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研究目的在分子水平上初步探讨我国大陆地区流行HAdV-4病毒株的基因特征与分子进化规律,为我国HAdV-4疫情的监测、相关疾病的诊断与防控以及疫苗研究提供基础数据。研究方法对2013～2015年间在发热呼吸道症候群监测病例中鉴定为HAdV-4阳性的临床标本进行病毒分离,对HAdV-4病毒分离株分别进行三个靶基因(Penton base、Hexon和Fiber)以及全基因组(Whole-genome sequences,WGS)序列扩增和测定,同时下载GenBank数据库中所有我国及全球流行HAdV-4病毒株的上述基因序列,构建基因数据库,并使用相关生物信息学分析软件进行基因特征和分子进化分析。研究结果(1)从2013～2015年间的发热呼吸道症候群监测病例获得HAdV-4病毒分离株共计6株,分别来自陕西(2株)、云南(2株)、吉林(1株)和山东(1株),覆盖我国东北、华东、西北和西南部地区;(2)基因亲缘性关系分析结果显示,全球流行HAdV-4病毒株可划分为HAdV-4p和HAdV-4a两个进化分支,我国大陆地区自2008年至今流行的HAdV4病毒株均属于HAdV-4a进化分支,与全球优势流行株一致;(3)HAdV-4病毒株Pentonbase,Hexon和Fiber基因序列的核苷酸和氨基酸突变主要与不同的进化分支密切相关,且在时间和空间上均具保守性和稳定性;(4)本研究HAdV-4病毒分离株均获得全基因组序列,全长35965～35969bp,G+C 含量为 56.26～56.29%,均有 47 个开放阅读框(Open Reading Frame,ORFs);(5)HAdV-4全基因组序列贝叶斯进化树与三个靶基因亲缘关系树拓扑结构一致,可划分为HAdV-4p和HAdV-4a两个进化分支。基于全基因组序列,估算HAdV-4进化速率为8.24×10-6碱基替代/位点/年,HAdV-4a和HAdV-4p进化分支可分别追溯至1915年和1900年,其中HAdV-4a进化分支推测可能在1984年左右传入我国;(6)ITR、E3 RID-alpha和E3 CRI-beta糖蛋白区域是HAdV-4病毒全基因组的高度变异区,其核苷酸和氨基酸突变主要与不同进化分支密切相关,而我国已知流行的HAdV-4病毒株在该区域高度保守。研究结论本研究首次阐明了我国大陆地区急性呼吸道感染病例中流行HAdV-4病毒株的三个靶基因以及全基因组序列的基因特征、遗传多态性和动态变异变迁规律,进一步积累并丰富了我国HAdV病毒学监测数据库,同时为我国的HAdV-4防控以及疫苗研发提供了重要科技支撑。图[17]表[9]参[66]