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目的:
1.分析线粒体DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)ND5基因序列。
2.探讨线粒体ND5基因变异与2型糖尿病(type2diabetesmellitus,T2DM)主要临床指标及其慢性并发症之间的关系。
3.寻找诊断T2DM的分子靶标。
方法:
1.根据1999年WHO糖尿病诊断标准,收集浙江籍汉族人群中确诊为T2DM的无血缘关系的215名患者,详细记录每例患者的临床资料,包括姓名、性别、年龄、发病年龄、身高、体重、家族史、并发症及主要生化指标;同时收集132名年龄匹配的健康体检者作为对照,排除高血压、高脂m症、脑血管病、糖尿病及家族史、口服葡萄糖耐量异常者。
2.提取全血基因组DNA;设计三对引物,通过聚合酶链反应扩增mtDNAnd5;PCR产物经纯化后直接进行测序分析,与剑桥参考序列(revisedCambridgeReferenceSequence,rCRS)进行比对,找出线粒体ND5基因的核苷酸变异位点。
3.分析T2DM组ND5基因变异;比较T2DM组与对照组各个变异位点的发生率,探讨ND5基因变异与T2DM的关系。
4.利用生物信息学软件ClustalX及蛋白质相关数据库,从氨基酸变异情况、蛋白结构分析ND5基因变异;结合统计学方法分析ND5基因变异与T2DM及其慢性并发症的相关性。
结果:
1.T2DM患者组和对照组的线粒体DNAnd5与剑桥参考序列比对存在着大量的基因变异,具有线粒体基因的多态性。在215例T2DM患者中发现线粒体DNAnd5有103个变异位点,132名对照中存在56个变异位点,其中32个位点既存在于T2DM患者组又存在于对照组中。经统计学分析,这些变异在两组间的分布并无统计学差异,推测大部分是一些多态性改变。
2.T2DM患者组中检测到31个错义突变其中18个已有报道,72个同义突变中40个已有报道。有些错义突变位于ND5基因高度保守位置,并导致了氨基酸极性的变化。利用蛋白质生物学分析软件分析ND5基因的二级结构,发现位于高度保守位置的T12338C和A12634G变异使ND5亚单位的二级结构发生改变,另有11个相对保守位置的氨基酸改变亦使ND5亚单位的二级结构发生变化。
3.将T2DM患者中有mtDNAND5基因变异的患者分为有家族史组和无家族史组:T12338C、G13708A两变异位点的变异率远高于无家族史组,其他变异位点无统计学差异。有家族史组女性患者发病率高、发病早、低密度脂蛋白(LDL-c)、糖化血红蛋白(HbAlc)与空腹血糖(FBG)明显高于无家族史组,并且更容易引起视网膜病变、周围神经病变以及肾病等微血管并发症。
4.将T2DM患者分为肥胖组与非肥胖组:C12717T、A13842G两个变异位点在两组之间的分布有统计学差异(p<0.05)。统计分析发现非肥胖组:有糖尿病家族遗传倾向;HbAlc、FBG、P2BG等均明显高于肥胖组;FINS、P2INS低于肥胖组;TC、TG等生化指标肥胖组高于非肥胖组人群,非肥胖组并发视网膜病变、周围神经病变以及酮症等微血管并发症的机率明显高于肥胖组。
5.根据T2DM慢性并发症(高血压、视网膜病变、周围神经病变和肾病)发生情况,对有变异的207例患者分别进行分组以及临床资料的分析,发现病程、BMI、HbAlc、FBG、PINS和TC、TG在不同的分组间差异有显著性。A13263G位点仅出现在高血压组。糖尿病并发肾病,视网膜病变,周围神经病变三者间有密切关系,三者均为糖尿病微血管并发症,这三者之间相互作用,相互影响。
6.T12338C突变使ND5基因起始位置的甲硫氨酸替换为苏氨酸,在T2DM组与对照组之间的分布无统计学差异,该位点变异使ND5蛋白的二级结构发生改变;T2DM患者有家族聚集倾向。
结论:
1.线粒体ND5基因存在大量变异,以碱基转换的点突变形式为主,推测大部分为线粒体DNA的多态性变异。
2.C12717T可能会增加2型糖尿病的发病风险,而A13842G在肥胖者中患有2型糖尿病的可能性更大。
3.线粒体ND5基因变异在T2DM并发症的分组中有显著差异。有基因变异的T2DM患者同时并发视网膜病变、周围神经病变、肾病、高血压的风险明显高于无基因变异的T2DM患者。这些表现与2型糖尿病本身的特点有关,但也不能排除这些变异位点增加了患病的风险性,还有待于我们进一步研究。
4.携带有T12338C突变位点的单体型F2人群可能对2型糖尿病易感。