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本研究首次建立了银杏AFLP体系,并以来自美国、法国、日本、荷兰及中国的39个银杏雄株种质为试验材料,首次进行了银杏雄株种质遗传多样性的AFLP分析。采用改良的CTAB法提取基因组DNA,经紫外分光光度计检测,OD值在1.60～2.0之间;经0.7%琼脂糖凝胶电泳检测,DNA带整齐清晰,没有明显拖尾,DNA链都在23kb左右。结果表明采用该法可以获得高纯度、高浓度的DNA。通过对影响AFLP技术的多种因素进行研究,建立了一套适合银杏的AFLP技术优化体系。优化的关键因素为:①模板DNA的质量:经多次抽提纯化,将DNA沉淀挑出,而不采用离心方法,获得高纯度的DNA;②酶切时DNA模板为300ng,反应时间为6h;③连接最适反应时间为10h;④预扩模板即连接产物最佳用量为1μl;⑤预扩增产物最适稀释倍数为70倍。利用筛选出的7对引物对39个雄株种质进行了遗传多样性的AFLP分析。7对引物共扩增出1242条带,其中多态带1219条,多态位点百分率为98.2%,每对引物的鉴别效率为100%。①国内及国外的雄株种质多样性分析中国群体的遗传多样性高于国外群体,法国、美国及中国三个群体的多态位点百分率为39.22%～92.52%,Nei’s遗传多样性在0.1402～0.2167间,Shannon’s信息指数在0.2095～0.3462之间,中国的最高,美国的最低。三个群体的Nei’s总遗传多样性Ht=0.2251,Nei’s群体内遗传多样性Hs=0.1706,Nei’s遗传分化系数Gst=0.2382,表明群体间遗传变异为23.82%。②中国不同省份雄株种质多样性分析广西、贵州、浙江及山东四个群体中,山东的遗传多样性最高,多态位点百分率为77.17%,Nei’s遗传多样性为0.2053,Shannon’s信息指数为0.3229;贵州的遗传多样性最低,多态位点百分率为14.60%,Nei’s遗传多样性为0.0605,Shannon’s信息指数为0.0885。广西、贵州、浙江、山东四个群体的Nei’s总遗传多样性为0.1981,Nei’s群体内遗传多样性为0.1272,Nei’s遗传分化系数Gst=0.3478,表明总的遗传变异中有65.22%发生在群体内。③泰安及郯城雄株种质的遗传多样性分析