联苯高效降解菌CL-2的筛选及其相关降解基因的克隆与表达

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本文从江苏某农药厂活性污泥池中分离筛选出一株联苯高效降解菌CL-2。通过观察菌株形态特征、生理生化特性并结合菌株16S rRNA测序序列分析初步鉴定菌株CL-2 为鞘酯菌属(Sphingobium)。研究菌株CL-2在LB 液体培养基中的生长特性发现,0-10h为菌株生长延滞期,10-23 h菌株处于对数生长期,23 h以后,菌株生长趋于稳定;NaCl浓度在0~15 g·L-1时菌株生长良好,当NaCl浓度大于15 g·L-1时,菌株生长受到抑制;菌株的最适生长温度为30℃,最适pH值为7.0-8.0;摇瓶装液量的越多,溶氧量越小,菌株生长量减小;当供试碳源为葡萄糖、果糖时菌株生长最好,提供氮源为蛋白胨时,菌株生长最佳。菌株CL-2在无机盐液体培养基中的降解特性研究结果表明,在30℃,pH值为7.0条件下,以5%的接种量接入菌株,28h内能够完全降解浓度为100 mg·L-1的联苯;提高底物浓度,菌株降解联苯时间延长,底物降解速率变慢,当底物浓度增加到500 mg·L-1时菌株降解受到抑制;采用劳麦方程对菌株底物降解动力学进行研究,拟合结果显示,菌株最大降解速率Vmax为19.57 mg·L-1·h-1,半速率常数Ks为32.89 mg·L-1。利用HPLC-MS分析菌株降解联苯中间产物,推测出三种代谢产物:2,3-二羟基联苯、2-羟基-6-氧-6-苯基己-2,4-二烯酸、苯甲酸。因此推断菌株代谢联苯的途径为:首先联苯2,3位上加一分子的氧形成联苯二氢二醇,接着联苯二氢二醇脱氢转化为2,3-二羟基联苯,2,3-二羟基联苯1,2位继续双加氧开环形成2-羟基-6-氧-6-苯基-2,4-己二烯酸,即黄色开环产物HOPDA,最后HOPDA被水解为苯甲酸和2-羟基-2,4-戊二烯酸.对菌株CL-2全基因组测序,利用比较基因组学技术比对分析出菌株代谢联苯的降解基因簇,结果显示其基因组织结构为bphC(orf1)bphD(orf2)(orf3)bphA1bphA2bphA3bphA4bphBbphH,与已报道的四种典型的联苯代谢基因簇在排列方式及基因组成上略有不同。利用分子生物学技术,克隆表达了2,3-二羟基联苯-1,2-双加氧酶,为微生物修复环境中的联苯污染及其工程化应用提供了一定的理论依据。
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