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金鱼(Carassius auratus var.)作为观赏鱼倍受人们喜爱,具有很高的经济价值。据史料记载,金鱼起源于我国的野生鲫鱼,隶属鲤目(Cypriniform),鲤科(Cyprinidae),鲫属(Carassius),鲫种(C. auratus)。目前总体看法认为金鲫鱼和草金鱼是从野生鲫鱼演化为金鱼的中间环节,金鱼的各品种(品系)可能是由草金鱼(或由其发展来的文种鱼)逐渐分化(家化)而来的,但对金鱼各品种间的微观差异及明确的系统演化关系仍未取得共识,有待于深入探讨。本论文利用SDS-PAGE (Sodium dodecyl sulfate-polymerization acrylamide gel electrophoresis)蛋白质标记和AFLP (Amplified fragment length polymorphism)标记技术对金鱼5个代表品种红白草金鱼、红白琉金、红白兰寿、红白虎头和红白龙睛间进行了遗传多样性分析研究。5个金鱼品种的肌肉蛋白组分的SDS-PAGE谱带多数是相同的,谱带数在12-14条之间,在谱带数目、带型、着色程度上仅存在细微的差异。平均每个品种的遗传相似度为0.9529,最大遗传距离在草金鱼与兰寿间为0.0833。最适合的AFLP引物组合是E+ATC/M+CAG,5个金鱼品种扩增出的AFLP标记共有200个,各品种扩增出的AFLP标记数在35-45之间,平均每个品种的AFLP标记数为40.0()个,各品种的多态性标记数在21-27之间,平均每个品种的多态性标记数为24.20个,各品种的多态性标记频率在46.67%-77.14%之间,平均每个品种的多态性标记频率为61.31%,5个品种的多态性标记频率都超过了45.00%,呈现较高程度的遗传多样性。总的来讲,各品种间的遗传相似度大小差异不大,平均每个品种平均遗传相似度为0.671,最大遗传距离在兰寿与龙睛之间为0.42。