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目的通过实时荧光定量PCR方法分别检测活动期、缓解期溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis，UC)患者腔菌群（肠道粪便标本）及膜菌群（肠粘膜标本）中梭菌属、肠球菌属、乳酸杆菌属、双歧杆菌属及拟杆菌属、大肠杆菌这六种菌群的含量，探讨UC患者肠道中腔菌群及膜菌群的差异，及肠道菌群改变在UC发病中的可能作用及意义。方法收集35例UC患者(活动期20例，缓解期15例)及20例健康体检者的粪便标本及乙状结肠活检组织，提取待测粪便标本及肠粘膜标本细菌DNA，根据细菌的16SrDNA序列设计特异性引物，应用实时荧光定量PCR(real-time PCR)法测定不同菌群的数量。结果1.腔菌群中，UC患者梭菌属、拟杆菌属、乳酸杆菌属、双歧杆菌属含量较正常对照组降低（9.62±1.13VS10.94±0.28；11.31±0.71VS12.4±0.39；8.13±1.45VS9.05±0.35；8.85±0.73VS9.54±0.79，P＜0.05）；大肠杆菌，肠球菌属含量增高（8.50±0.52VS8.03±1.02；9.33±0.65VS8.73±0.84,P＜0.05）；肠道定植抗力B/E值下降（1.05±0.13VS1.20±0.19,P＜0.05）。对不同病期UC患者腔菌群的研究中发现，活动期UC患者梭菌属，乳酸菌属，双歧杆菌属，拟杆菌属含量较正常对照组下降（8.83±0.81VS10.94±0.29；7.48±1.59VS9.05±0.35；8.55±0.79VS9.54±0.79；11.11±0.88VS12.42±0.39）；肠球菌属，大肠杆菌含量升高（9.63±0.39VS8.54±1.08；8.74±0.53VS8.03±1.02）。而缓解期UC患者拟杆菌属含量下降（11.56±0.21VS12.42±0.39），梭菌属、肠球菌属，双歧杆菌属、乳酸菌属及大肠杆菌与正常对照组差异无统计学意义（10.67±0.35VS10.94±0.29；8.94±0.72VS8.54±1.08；9.26±0.38VS9.54±0.79；9.01±0.53VS9.05±0.35；8.17±0.30VS8.03±1.02）；活动期UC患者B/E值较对照组下降（0.98±0.13）＜1，缓解期和正常对照组B/E值均＞1（1.14±0.08VS1.21±0.19），两组差异无统计学意义。2.膜菌群中，UC患者拟杆菌属、乳酸杆菌属、双歧杆菌属含量较正常对照组下降(8.80±0.66VS9.88±0.82；6.82±1.07VS8.0±0.68；8.41±0.72VS9.42±0.98,P＜0.05)；梭菌属、大肠杆菌、肠球菌属含量与正常对照组差异无明显统计学意义（9.00±0.79VS9.36±0.66；9.26±0.87VS8.91±0.52；7.46±0.82VS7.7±1.17,P＞0.05）；B/E值＜1（0.91±0.10VS1.06±0.08），较对照组显著下降。对于不同病期UC患者膜菌群研究发现，活动期UC患者的双歧杆菌属、拟杆菌属、乳酸杆菌属、梭菌属含量减少(8.06±0.21VS9.42±0.78；8.34±0.29VS9.88±0.82；6.29±0.52VS7.96±0.68；8.52±0.30VS9.36±0.66)，大肠杆菌含量较正常对照组增加(9.68±0.56VS8.91±0.52)，肠球菌属与对照组差异无明显统计学意义(7.19±0.32VS7.7±1.17)；缓解期UC患者拟杆菌属及双歧杆菌属含量减少(9.42±0.48VS9.88±0.82；8.87±0.89VS9.42±0.78)，大肠杆菌、乳酸杆菌、梭菌属、肠球菌属含量与对照组差异无统计学意义(8.7±0.9VS8.91±0.52；7.52±1.22VS7.96±0.68；9.63±0.79VS9.36±0.66；7.83±1.12VS7.7±1.17)。活动期UC患者B/E值＜1（0.84±0.05），较正常对照组降低，缓解期UC患者B/E值与对照组B/E值均＞1(1.02±0.04，1.06±0.08)，且两者间差异无统计学意义。结论1.UC患者腔菌群和膜菌群均存在明显变化，提示UC患者存在肠道菌群失调。2.UC患者在腔菌群和膜菌群变化上并不完全相同。UC患者腔菌群和膜菌群菌群失调均以活动期患者更为明显，提示肠道菌群改变与UC发生发展相关。3.实时荧光定量PCR法可为肠道菌群定量提供准确、可靠的方法。