茄子种质资源遗传多样性SSR和SRAP分析

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茄子(Solanum melongena L.)起源于亚洲南部热带地区,古印度为其最早的驯化地,中国栽培茄子的历史悠久,被认为是第二起源地,拥有丰富的茄子种质资源。进行茄子种质资源的遗传多样性研究,对茄子种质资源的搜集、保存、鉴定、创新及育种工作都有重要意义。本试验对来自中国13个地区及印度、法国等35个国家的222份茄子种质资源,利用SSR和SRAP两种分子标记方法进行了遗传多样性分析。主要结果如下:1.采用正交试验设计,从Mg2+、Taq酶、dNTPs、引物及模板5种因素4个水平对SSR反应体系进行优化,建立了适合于茄子的SSR-PCR优化反应体系,即10μL反应体系组成为:10×Buffer 1μL,25mmoL/L Mg2+ 1.5μL,2.5mmoL/L dNTPs 0.8μL,10μmoL/L引物1.0μL,50ng/μL模板DNA1.5μL,5U/μL Taq酶0.1μL,无菌水3.2μL。2.从供试材料中选取形态学上差异较大的5份栽培茄和3份野生茄材料用于引物筛选。从416对SSR引物中筛选出5对多态性高、条带清晰的引物;从431对SRAP引物中筛选出25对重复性好的多态性引物。3.利用筛选出的5对SSR引物和25对SRAP引物对供试的222份茄子材料进行PCR扩增,5对SSR引物共扩增出23条清晰度高、重复性好的条带,平均每对引物产生4.6条,具有多态性的条带为22条,占总扩增带的96%。其中栽培茄产生的多态性条带比例为65.2%。25对SRAP引物共扩增出239条清晰度高、重复性好的条带,平均每对引物产生9.6条,多态性条带比例为100%。其中栽培茄产生的多态性条带比例为74.9%。4.应用Structure软件对扩增结果进行遗传多样性和群体结构分析,将供试材料分为5个亚类群——S1、S2、S3、S4、S5,分别包括31、11、66、51和63份材料;类群的划分与地理来源存在一定关系:S1类群材料大都来自尼日利亚等非洲西南部国家,S2类群材料大都来自多哥等非洲国家,S3材料大都来自中国、印度等亚洲国家,S4类群材料来自土耳其等亚洲国家,S5类群材料大都来自亚洲的中国。类群的划分未能体现与果形和果色的直接相关性,但存在一定的规律:浅绿和白色茄子材料主要分布在S1和S3类群,绿色茄子材料主要分布在S2类群,深色(黑和紫)茄子材料则主要分布在S3、S4和S5类群;扁圆形状的茄子材料主要分布在S1和S2类群,长筒、卵圆、长卵和圆球性状的茄子材料主要分布在S3、S4和S5类群。5.基于Structure软件的分类结果,根据供试材料的扩增电泳条带构建了各亚类群的指纹图谱。
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