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小麦是我国重要的储备粮和商品粮，矮秆基因的研究与利用是小麦遗传育种的重要研究方向之一。本研究以宁春4号、宁春40号、宁春44号（均含有Rht-D1b）与MagnifM1（含有Rht13）杂交的F2群体为主要材料，分析F2群体中Rht13和Rht-D1b互作对农艺性状的影响，利用比较基因组学的研究方法开发Rht13的分子标记，并构建小麦Rht13基因区段的遗传连锁图谱。主要研究结果如下: (1)通过对宁春4号、宁春40号、宁春44号分别和Magnif M1杂交的F2代植株株高、穗长、倒二茎节长等农艺性状的调查分析，结果表明，各组合F2代材料中株高、穗下茎节长和倒三茎节长的广义遗传力较高;变异系数较大的性状为倒三茎节长和穗粒数，最小的性状均为穗长。矮秆基因Rht13对降低小麦株高的效应比Rht-D1b强，Rht-D1b和Rht13互作的降秆能力要比两个单矮秆基因更强。在两年四个杂交组合F2代中，高秆系(rht13+Rht-D1a)的各个性状值均为最大，双矮秆系（Rht-D1b+ Rht13）的各个性状值均为最小，双矮秆系（Rht-D1b+Rht13株高较高秆系分别降低了21.54％、26.54％、23.94％和18.46％，且均达到显著水平。双矮秆系与高秆系的其他农艺性状的差异也达到了显著水平。同时，三个矮秆系与高秆系相比，各个茎节的直径显著减少。双矮秆基因（Rht-D1b+Rht13）和单矮秆基因Rht1显著降低了相对叶绿素的含量;在产量性状方面，双矮秆系的各个性状均显著低于高秆系，不利于产量性状的形成。研究结果显示Rht-D1b和Rht13的互作对株高和产量性状具有负向累加效应。 (2)通过对现有标记的筛选以及小麦与水稻、二穗短柄草、大麦及谷子的矮秆基因和赤霉素基因进行比较基因组学分析，结果得出:60对已注释标记中有19对分子标记在双亲（宁春4号和Magnif M1）中存在多态性，占总标记的31.6％，其中有两对分子标记为显性标记;对现有水稻、二穗短柄草、大麦和谷子以及小麦的矮秆基因和赤霉素基因聚类分析发现，各基因间均具有一定的同源性，根据比对结果，设计了54对新引物，其中，只有两对引物在双亲多态性检测中具有多态性，分别命名为7BLSSR1（来源于水稻第11号染色体多蘖矮秆基因d27）和7BLSSR2（来源于小麦7DL的赤霉素基因Traes_7DL_F51807989）。 (3)利用多态性标记构建小麦7B染色体Rht13基因区段的连锁遗传图谱，长度为64.8cM，分子标记间的平均距离为3.6cM。运用单标记分析法检测到了与矮秆性状相关的QTLs位点，其中标记Xgwm577对株高表型的贡献率最高，为21％;且该QTLs定位在7B染色体SSR标记Stb8-Xgwm577之间。经过对宁春4号与Magnif M1杂交得到的F2和F3代的遗传分析得出，Rht13是一个隐性遗传的矮秆基因。