福建闽江上下游之间经济的不平衡性,促使明代至清代初期上下游以粮盐为主的大宗货物运输的发生与发展。五口通商之后,闽西北茶叶、土纸等土特产品的大量外运,进一步促进了闽江航运的发展与繁荣,19世纪中后期福州港更是一跃成为举世闻名的茶港。这段时期闽江航运业的发展,主要表现为:沿岸城镇水埠码头的兴起;浅水船型的建造与改进;以地域和船型为区分的船帮组织的成立。伴随着闽江航运业的发展与进步,中央王朝与地方政府逐步加深了对水域管理的认识。明代早中期的河泊所制度,因阻碍了闽江沿岸渔业经济的发展,到明代中后期已经基本消失。明代中晚期,在闽江上游建溪流域,出现了埠头制度,这是航运和商品经济发展到一定阶段出现的产物,清代前期,埠头因多为地痞把持,劫掠船货,成为闽江航运极大的隐患,故在嘉庆年间被取缔。而浦城、光泽则率先兴起了船行制度,船行皆由地方殷实良民充当,并制定了保险规则,保障了商旅行货的安全,得到了地方政府的支持,很快在闽江上下游之间得到推广。与此同时,清代前期,闽江沿海地区海盗贼寇猖獗,地方政府为加强对沿海渔民、船户的管理,推行澳甲和船照制度,并将澳甲与船照制度加以修改,运用到渡船和中上游渔民、船户管理制度当中。说明中央王朝和地方政府对河道水域社会认识是不断加深的,管理方式也随着流域的不同以及船民群体的差异而有所改变。与政府治理相呼应的是民间组织对闽江河道社会的影响和作用,在清中叶以前主要变现为船民、渔户为了生存寄入沿江的势家大族,这样河道船运、渔业间接的被沿江的“洲主”、埕主所掌控。清中叶以后,随着商品运输的盛行,部分船民经济实力有所增强,开始作为独立的个体经营船运业,为了应对闽江流域复杂的社会、自然环境,船民结成船帮。船帮组织的成立,成为船民参与治理河道社会的一个重要保障,这样就更凸显了闽江河道社会管理中的复杂性与多元性,为进一步认识及研究交通运输在河道管理制度嬗变中的作用和意义,提供了新的思路与角度。