胃癌、结直肠癌SEPTIN5,8,9甲基化的研究及其意义

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【目的】建立一种简单可靠的基于MS-HRM技术的高通量的检测DNA甲基化分析方法,并研究分析SEPTIN家族中的SEPTIN5、SEPTIN8、SEPTIN9基因启动子甲基化在胃癌、结直肠癌的临床意义。【方法】1.采取改进的乙醇沉淀法纯化回收重亚硫酸钠处理后的DNA(Bis-DNA)的方法,并与常用的Promega Wizard DNAClean-up System试剂盒进行了比较。2.结合MS-HRM技术,以picogreen为分析染料,以3种克隆质粒[插入的目的片段为91bp,插入片段的测序图见附录B。质粒2与质粒3之间只相差一个碱基(C>T)]为分析模板,以此来对picogreen的灵敏度进行评价。3.结合以上两步,建立一个高通量的检测DNA甲基化分析方法。4.用上述方法检测34例结直肠癌组织中的SEPTIN9甲基化水平,对新建立的方法进行临床应用评估。5.用上述方法检测胃癌细胞系SGC7901和AGS、9例胃癌新鲜组织及相应的癌旁组织、73例胃癌石蜡包埋组织和39例胃癌癌前标本中的SEPTIN9甲基化水平。6.采用BSP(重亚硫酸钠处理后测序法)研究确定SEPTIN5和SEPTIN8基因启动子区发生甲基化的具体位点。【结果】1.本研究建立的纯化方法回收率可达63.1%,显著高于常用的Promega WizardDNA Clean-up System试剂盒(38.7%)。并且操作更简便。2.采用picogreen为MS-HRM的分析染料,可检测低至0.5%的甲基化DNA。可区分单碱基差异。3.方法验证中34例结直肠癌组织中33例(97.0%)检测到了SEPTIN9甲基化,与文献报道一致,说明本研究中建立的基于MS-HRM技术的高通量的检测DNA甲基化分析方法可用于临床研究。4.胃癌细胞珠SGC7901和AGS均存在SEPTIN9甲基化。72.0%(59/82)的胃癌组织检出SEPTIN9甲基化,只有22.2%(2/9)癌旁组织可检测到SEPTIN9甲基化。癌前病变SEPTIN9甲基化的检出率高达74.4%(29/39)。胃癌SEPTIN9甲基化与胃癌的临床分期、浸润程度和淋巴结转移程度这些临床病理参数之间的差异没有统计学差异(χ~2=3.835、1.041、0.242,P=0.051、0.308、0.623)。中、高分化程度的胃癌组织SEPTIN9甲基化(88.6%,39/44)明显高于分化程度低的胃癌组织(52.6%,20/38),且有显著的统计学意义(χ~2=13.098,P=0.0001)。男性患者胃癌组织SEPTIN9甲基化(80.4%,45/56)高于女性患者(53.8%,14/26),两者之间的差异有统计学意义(χ~2=6.184,P=0.013)。肠型胃癌SEPTIN9甲基化(83.3%,45/54)明显高于弥漫型胃癌(50.0%,14/28),且有显著的统计学意义(χ~2=10.152,P=0.001)。5. RKO细胞株SEPTIN5启动子区并未发生甲基化,但是SEPTIN8启动子区上游-200至-5区有4个位点胞嘧啶发生了甲基化,用MTA处理RKO细胞后,这4个位点去甲基化。【结论】1.本研究中建立的方法可用于临床研究。2. SEPTIN9甲基化可能促进胃癌发生。SEPTIN9有望成为胃癌早期诊断的分子标记物。3. SEPTIN8可能在结直肠癌发生或发展进程中扮演重要角色,MTA可以逆转SEPTIN8启动子甲基化。
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