青藏高原土壤和印度洋深海沉积物可培养放线菌的分离培养与多样性

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放线菌广泛分布于土壤和海洋等生境中,在产生生物活性物质、有机物降解和物质循环中都发挥着举足轻重的作用,是重要的微生物资源。特殊或极端生境中往往包含特殊的微生物资源。青藏高原有“第三极”之称,具有高海拔、低气温、长日照、强辐射等气候特征;而深海则是黑暗、高压、低温、寡营养的复合极端环境。目前青藏高原和深海放线菌的多样性尚未清楚。本论文在对青藏高原土壤和印度洋深海沉积物可培养放线菌的多样性研究中取得如下进展:  使用多种选择性培养基,并尝试添加藤黄微球菌发酵液,对采集自青藏高原北部的14份土壤样品进行了放线菌分离,进而通过16S rRNA基因序列分析对分离菌株进行初步分类鉴定,并在不同分类水平上统计所分离得到的放线菌多样性。共得到去重复后的放线菌255株,分布于放线菌门、放线菌纲的8个目、13个科、23个属,包含94个可能的物种。其中至少25个物种可能为新种,分布于13个属。链霉菌属的菌株108株,可能的物种28个,是最主要的优势菌属。分离培养基中添加藤黄微球菌发酵液明显增加了放线菌分离菌株的数量和多样性,稀释的葡萄糖酵母麦芽汁培养基适合分离链霉菌,而淀粉甘油脯氨酸培养基、丙酸钠酪蛋白培养基等则适合分离稀有放线菌。  通过多相分类确定一株分离自西藏阿里地区土壤的伦茨氏菌FXJ1.1311T属于一个新种,命名为Lentzea xizangensis sp.nov.,与分离自黄金矿坑土壤的Lentzea violacea亲缘关系最近,16S rRNA基因序列相似性为98.11%。  此外,使用多种培养基和多种分离手段对采集自印度洋卡尔斯伯格洋脊的10份沉积物样品进行了放线菌分离,结果仅得到放线菌14株,分布于放线菌门、放线菌纲的3个目、5个科、6个属,包含12个可能的物种。虽然没有分离得到样品中最优势的酸微菌类群,但是通过比较确定了一种相对适用于分离深海放线菌的方法,即海藻酸钠微球法。  本论文为青藏高原土壤放线菌的分离和多样性评估提供了有价值的参考,为研究该地区放线菌的次级代谢潜力和生态功能提供了较为丰富多样的菌株资源;同时,提出海藻酸钠微球法是分离深海沉积物放线菌较为有效的方法。
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