磷脂酰肌醇磷酸衍生物,或简称PIPs,是一类十分重要的脂类信号分子,它们是维持生物膜局部区域特异性的膜相关信号系统中的基础元素。最近的研究指出,酿酒酵母中最主要的磷脂酰肌醇/卵磷脂转移蛋白(PITP) Secl4p在PIP信号通路中,起着调节磷脂酰肌醇4-OH激酶(PtdIns4-OH kinase)活性的重要作用。在这个过程,Sec14扮演了一个关键的“双重角色”,它既是对卵磷脂分子的探测器,又是磷脂酰肌醇的微型反应器,它采用一种“向前推进”的策略,通过向PIP信号分子合成代谢过程提供磷脂酰肌醇磷酸化反应的高效微环境而调节这一信号系统。Sfh3蛋白同Sec14具有24%的序列相似度。但是与Sec14不同的是,Sfh3并没有在体内表现出卵磷脂结合/转移的生物活性。在我们的研究中,我们首次报道了Sfh3的同二聚体晶体结构,这与所有已知的Sec14家族蛋白结构都不相同(已知结构报道都是单体)。在已经获得的Sfh3结构中,我们发现结构存在至少三点特异性：第一,Sfh3的底物结合口袋比所有已知结构的Sec14家族蛋白都要大得多,这点暗示Sfh3的结合口袋可能有结合更大的脂类分子的可能性；第结构中的二体相互作用界面深刻地影响了Sfh3的底物结合口袋,从而导致蛋白“空”构象与底物结合的分子聚合状态变化；第三,Sfh3的底物结合口袋除了结合PtdIns的保守位点外,几乎不存在其他任何可以供极性基团靠近的亲水区域。这三点都暗示Sfh3可能存在新的结合底物,这与之前对于Sec14家族蛋白功能解释的相关推测是一致的。在真核细胞中,脂类分子的蛋白质修饰是一类蛋白质分子的重要特性。在脂类修饰中,棕榈酸化是唯一的一种可逆的翻译后脂类修饰,它在蛋白质分子亚细胞器动态定位,蛋白质活性,稳定,复合物的组装等方面扮演着重要的角色。其中,棕榈酸化可以自发反应或者被酯质蛋白转移酶(PATs)催化而去棕榈酸化则被酯质蛋白硫醇酯酶(APT)所催化。在人类细胞中,存在着两种APT酶；而在酿酒酵母细胞中,只有一种蛋白,yAPT1,能够催化去棕榈酸化。yAPT1存在着酯质蛋白硫醇酯酶和普通酯酶的两种活性。但是在体外yAPT表现出对蛋白质底物的酶活能力是对小分子底物的酶活能力的数百倍。更进一步地,与其他哺乳动物的APT酶相比,yAPT1表现出显著的对不同蛋白质底物的选择性。这种底物选择性的结构基础目前仍然尚不清楚。为此,我们收集了yAPT1蛋白质晶体的2.40A的XRD衍射数据,同时蛋白质的晶体结构也得到了解析。