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辽河保护区综合管理的实施，目标在于改善与修复辽河的水环境和水生态并给予保护。由于辽河保护区支流接纳了周边城市的生活污水及工业废水，后汇入干流，因此成为干流污染物的重要来源。为了实现修复辽河保护区的目标，通过恢复湿地净化功能与建设相关工程，将两者相结合来缓减支流污染负荷、增强水体自净能力。本论文在检测辽河保护区水体水质情况后，重点研究了干流、支流及河口湿地中溶解性有机物（DOM）分布组成、来源及迁移转化，通过克隆文库技术分析了七星湿地中不同植物根际微生物结构和多样性，从而进一步揭示溶解性有机物在辽河保护区的环境行为特性、微生物对不同植物生长环境影响，为辽河保护区的水生态修复情况提供基础资料。在对辽河水质指标进行监测的基础上，运用三维荧光光谱（3DEEM）结合荧光区域积分（FRI）分析方法。研究结果表明：辽河保护区的水质较差，干流、支流和河口湿地的COD、NH4+-N均有不同程度的超标现象；荧光指数f450/500值在1.53～1.92之间，平均值为1.71，表明辽河保护区DOM中的腐殖质主要是生物来源；荧光区域积分可以表征出划分的5个区域有机物相对含量的变化趋势，且芳香性蛋白类物质占到了44.15%～66.50%，是主要的污染物；腐殖化指数r（B,D）干流为1.70±0.094、支流为1.726±0.231、河口湿地为1.662±0.138；皮尔森相关性分析的结果表明，荧光指数可以对水体溶解氧(DO)和氨氮(NH4+-N)具有指示作用。克隆文库结果表明：在芦苇、菖蒲和香蒲三种植物根际的微生物中，其优势类群均为变形细菌（Proteobacteria）且大部分属于Betaproteobacteria；其次是酸杆菌门（Acidobacteria）。拟杆菌（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、硝化螺旋菌门（Nitrospirae）和疣微菌门（Verrucomicrobia）在各植物中所占的比例不同。这些微生物种群与植物生长、湿地净化功能都有密切关系。