基于生物信息学数据库分析CDCA8在肺腺癌预后中的意义及其表达失调的可能机制

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目的:通过生物信息学研究CDCA8(细胞分裂周期相关基因8)在肺腺癌预后中的意义及其表达失调的可能机制,为探讨肺腺癌新的分子治疗靶点及预后标志物提供科学依据。方法:首先通过基因表达谱交互分析(GEPIA)、基因表达综合数据库(GEO)、癌症基因组图谱数据库(TCGA)、肿瘤芯片数据库(Oncomine)、UCSC Xena网站、人类蛋白组图谱(THPA)及c Bio Portal数据库获取CDCA8相关数据,包括mRNA表达量、mi RNA表达量、蛋白表达量、基因拷贝数(CAN)、DNA甲基化数据及临床信息等数据,然后使用t检验和卡方检验确定了CDCA8 mRNA、CDCA8蛋白、CDCA8潜在调控mi RNA表达水平和CDCA8 mRNA在肺腺癌中的临床意义。通过Kaplan-Meier(K-M)分析、Cox回归分析评估了CDCA8 mRNA在肺腺癌中的预后价值。最后使用GO、KEGG富集分析及基因富集分析(GSEA)筛选出与肺腺癌中CDCA8表达相关的生物学途径。结果:与正常肺组织相比,肺腺癌组织中CDCA8在基因和蛋白质水平均表达上调(P<0.05)。Kaplan-Meier(K-M)分析表明,肺腺癌中CDCA8 mRNA与肺腺癌总体生存期(OS)和无病生存期(DFS)密切相关,CDCA8 mRNA高表达患者的OS、DFS显著劣于低表达患者(P均<0.05)。单因素和多因素Cox回归分析表明,CDCA8 mRNA高表达是总体生存期(OS)和无病生存期(DFS)独立的预后危险因素(P均<0.05)。此外,CDCA8 mRNA表达上调与其基因拷贝数变异扩增呈正相关,但与其甲基化呈负相关(P<0.05),并且hsami R-140-3p的下调与CDCA8 mRNA的上调有关(P<0.05)。GO富集分析、KEGG富集分析和基因富集分析(GSEA)显示CDCA8可能主要通过细胞周期通路、DNA复制信号通路及剪接体参与肺腺癌的促癌作用(P均<0.05)。结论:CDCA8在肺腺癌组织中表达上调,这与肺腺癌中CDCA8 DNA拷贝增加和hsa-mi R-140-3p下调有关,且其高表达可能是肺腺癌中独立的预后危险因素之一,它可能主要通过细胞周期通路、DNA复制信号通路及剪接体参与肺腺癌的促癌作用。
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