曲霉与人类的日常生活具有密切关系。有些曲霉在人类生产实践中已被安全应用了近千年,有些曲霉能产生真菌毒素,对农业生产及食品安全造成危害,还有一些曲霉能引起人及动物的侵袭性感染。为了阐明曲霉不同菌种间的系统发育关系及分类地位,澄清不同曲霉之间的亲缘关系与进化路径,本研究对具有重要经济应用价值和临床上常见的共26个种的曲霉进行了系统发育分析。通过对曲霉四种持家基因GAPDH基因、β-tubulin基因、MTO1基因和HSP70基因的编码区部分序列设计兼并引物,对这些基因进行了扩增测序,并提交GenBank。在此基础上对各基因的碱基组成、碱基替换特征及各基因序列间的P距离进行了分析。并采用邻接法(NJ)、非加权分组平均法(UPGMA)法、最大似然法(ML)及最大简约法(MP)对各基因及四种基因的联合序列构建了系统发育树。通过分析,对这26种曲霉的系统发育关系及分类地位进行了阐述,并结合形态学特征对一些菌株进行了重新的鉴定和分类。在以上相关工作基础上,通过对曲霉四种基因测得序列的比对分析,针对病原性烟曲霉、构巢曲霉及黑曲霉的特异位点设计引物及Taqman探针,建立了应用Real-time PCR技术快速检测这三种病原性曲霉的方法。