DNA醛基修饰的选择性荧光标记研究

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醛基是DNA中天然核苷酸修饰的重要基团,在表观遗传学的研究中具有重要意义。这些醛基修饰碱基包括5-醛基胞嘧啶(5fC),5-醛基尿嘧啶(5fU),脱碱基位点(AP),它们在真核生物和原核生物的基因表达调控中发挥关键作用,并且修饰水平与某些疾病密切相关。5fC,5fU,AP三者之间存在某些联系,比如参与DNA的主动去甲基化、改变DNA的结构和稳定性从而造成DNA损伤,与蛋白质发生作用形成DNA-蛋白质交联物等,因此,本论文以三种碱基为共同研究对象,致力于用小分子荧光探针同时标记和检测它们。本论文设计并合成了萘酰胺-羟胺和萘酰胺-乙二胺两种探针,通过分别比较两者与三种不同含有醛基的碱基单体反应的活性和稳定性,最终选定萘酰胺-羟胺为较佳的探针。本论文用该探针首次选择性标记了DNA中含有的全部天然醛基包括5fC、5fU和AP,而该探针对其他基团如羟甲基,甲基等修饰的碱基不起作用,表明了探针分子对醛基的高度特异性。本论文详细研究了产物的荧光特性,讨论了羟胺对DNA中醛基的反应活性,为设计选择性标记修饰DNA的化合物提供了重要参考,期望未来本论文设计的探针能用于活体内醛基的定量检测。
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