【摘 要】
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E-钙粘附素(E-cadherin, E-cad)是一种粘附分子,是细胞粘附素家族(Ca2+dependent cell adhesion molecule family)中的一员,主要介导细胞间同质粘附的钙依赖性跨膜糖蛋白,对
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E-钙粘附素(E-cadherin, E-cad)是一种粘附分子,是细胞粘附素家族(Ca2+dependent cell adhesion molecule family)中的一员,主要介导细胞间同质粘附的钙依赖性跨膜糖蛋白,对维持正常上皮细胞形态和结构完整性起着重要作用。模体是蛋白质序列中的一段保守区域,保守性通常在进化过程中呈现,对研究蛋白质的功能起着重要作用。因此,通过对E-钙粘附素序列模体的特征分析来研究E-钙粘附素的结构和功能具有重要意义。本文中,利用搜索序列模体的方法找到了E-钙粘附素序列的功能模体。为了更好地理解E-钙粘附素的粘附机理,本文从数据库Swiss-Prot提取了实验上已经确认的142条E-钙粘附素序列,利用InterPro、MEME、PROSITE等分析工具对序列一致性(identity)(序列之间完全相同的部分所占的比例)小于等于25%的E-钙粘附素序列进行模体搜索。通过InterPro确定了14条主要的功能模体,用MEME分析得到了50个模体,最终整合InterPro、PROSITE和MEME得到了特征模体。利用这些模体可以搜寻出蛋白质的结构特征,以及残留的约束配体和生物功能的活性部位,为理论研究和生物学实验提供了参考。
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