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利用高通量生物芯片技术，通过对胃癌中DNA拷贝数和mRNA表达谱的分析，以期发现新的与胃癌诊断和分型、预后和治疗相关的基因，为后续深入了解胃癌发生发展过程奠定基础。经严格病理检查的27对胃癌和癌旁配对组织，采用激光显微切割技术获得高纯度胃癌和癌旁正常细胞，应用比较基因组杂交芯片和基因表达谱芯片检测胃癌样本的基因组拷贝数变异和转录组表达谱改变，并进行整合分析研究。比较基因组杂交芯片发现染色体8q11.1-q24.3区段拷贝数扩增频率最高（70%），其次为20q11.21-q12（52%）；同时，拷贝数缺失频率最高的区段为6p25.3（33%）。结合临床病理信息，发现了一些与TNM分期以及分化相关的变异区段。基因表达谱芯片发现了260个显著差异表达基因，并且CTHRC1与胃癌的侵袭相关。通过拷贝数与表达谱芯片数据的整合分析，发现了163个基因的表达与拷贝数变异相关，同时发现区段20q13.33上的C20orf11基因在中分化的胃癌样本中扩增且高表达。通过对8q区段32个显著过表达基因的逐步逻辑回归分析，发现了4个基因（SULF1, INTS8, ATP6V1C1与GPR172A）的组合能区分25对胃癌与癌旁样本，并且达到98.0%的平衡精度（AUC=0.995）；其中SULF1与胃癌的侵袭与转移相关，并且第一次揭示GPR172A的拷贝数扩增和过表达与胃癌相关。四基因组合的功能预测表明，细胞内区室的酸性环境稳态可能在胃癌的发生发展中起着重要作用。除此之外，首次发现8q11.21区段内MCM4, PRKDC与UBE2V2以及8q22.3区段内YWHAZ, ANKRD46, ZNF706与GRHL2在各自区段扩增的样本中表达一致性地上调。通过不同芯片平台的综合分析，本研究发现的与分期以及分化相关的变异区段有助于临床病理分型，发现的4基因组合有助于提高胃癌诊断的准确性，且首次发现了与分化相关的C20orf11以及验证了以往报道与侵袭转移相关的SULF1与CTHRC1。除此之外，还发现了一些候选标志物（GPR172A, UNQ473, MCM4,YWHAZ等），加深了对胃癌发生发展的理解。