退变性腰椎间盘中髓核细胞的差异蛋白质筛查研究

来源 :湖南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaotiantiandetian
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目的:在退变性腰椎间盘与正常腰椎间盘中,对椎间盘的髓核细胞进行差异表达蛋白的筛查研究。建立退变性腰椎间盘髓核细胞的差异表达蛋白信息库。方法:本研究收集退变腰椎间盘的髓核细胞与正常腰椎间盘(对照组)的髓核细胞样本,运用蛋白质组学的TMT技术,筛查找到表达量上下调的以及所有的差异蛋白。构建腰椎间盘退变组与对照组的髓核细胞差异蛋白质图谱。通过质谱鉴定技术,对差异表达蛋白质进行鉴定。然后利用生物信息学GO注释,分别寻找到参与的生物过程、分子功能和细胞组分的差异蛋白质。使用GO功能富集以及KEGG通路富集筛查目标蛋白质参与的主要通路,最后研究在GO功能和KEGG通路富集中共有的差异表达蛋白质。结果:本实验通过蛋白质组学分析的TMT技术,发现在腰椎间盘髓核细胞中共鉴定到二级质谱的谱图总数为284386个;鉴定到的肽段总数为12678个;能够鉴定到的单一的肽段总数为11626个;鉴定的肽段能够匹配到的质谱图总数为51303个;能够鉴定到的蛋白质总数为1885个。通过蛋白质定量分析,发现在腰椎间盘髓核细胞中,在正常对照B组与退变A组之间,检测出的下调的、上调的以及全部的差异蛋白数分别为64个、9个以及73个。GO注释表明在生物过程方面,所有差异蛋白均参与生物调节。在分子功能方面,所有差异蛋白均参与结合活性。在细胞组分方面,所有差异蛋白均参与组成细胞器和细胞部分。通过Fisher精确检验,生物学蛋白质的富集结果阐明:髓核细胞的73个差异蛋白中有48个蛋白质显著富集在30个隶属生物学过程的GO term之中。利用KEGG通路富集,在符合校正P值<0.05的条件下,筛查到了三个通路:自噬-其他,初级胆汁酸生物合成和神经活性配体-受体相互作用。这三个通路中共同富集的差异表达蛋白质有5种。结论:本研究对退变性腰椎间盘与正常性腰椎间盘中的髓核细胞进行蛋白质组学分析,检测出的下调的、上调的以及全部的差异蛋白数分别为64个、9个以及73个。筛查到三个通路中共同富集的5种差异表达蛋白。建立了退变性腰椎间盘中髓核细胞的差异表达蛋白质的信息库。
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