本研究利用ISSR（内部简单重复序列）技术对Thatcher及22个以Thatcher为轮回亲本的小麦抗叶锈病近等基因系（NILs）进行分析，结果如下： 1．建立了一套适合本研究的小麦ISSR分析的最优化反应体系及反应程序。通过以小麦基因组DNA为模板，对1SSR反应体系及反应程序中的一些重要参数进行摸索和优化试验。本研究所用反应体系为：25μl反应体系中含有10mMKCl、8mM（NH₄）₂SO₄、10mM Tris-HCl（pH9.0）、NP-40、2.0mM Mg²⁺、150μM dNTP、200nM引物、60ng模板DNA、2.0UTaqDNA聚合酶。反应程序为第一个循环基因组DNA经94℃预变性3min；40个循环为94℃变性30sec，48℃退火60sec，72℃延伸2min；最后一个循环完成后，在72℃下延伸7min。 2．通过对Thatcher及小麦抗叶锈病近等基因系的ISSR分析找到一个与Lr37基因连锁的ISSR标记。研究采用100个ISSR引物对小麦抗叶锈近等基因系进行了分析，其中绝大多数引物能扩增出清晰可辨的条带。经过多次重复发现有两个引物UBC812和UBC848在小麦抗叶锈基因Lr37近等基因系间表现多态性。当用这两个引物对含Lr37基因的抗病材料VPMl+Trident、Hyak、Madsen及其它不含Lr37基因的感病材料进行检测时，标记UBC812-1200可以从三个含Lr37基因的抗病材料中检测到一条1200bp的多态性带，而在其它感病材料中，没有这条1200bp的条带，初步表明标记UBC812-1200与Lr37基因连锁。而标记UBC848-700不能将不同遗传背景中的Lr37基因检测出来，表明UBC848-700的特异性差，同时说明标记UBC848-700的结合位点与Lr37基因不连锁。 3．为了进一步确定ISSR标记UBC812-1200与Lr37基因连锁的紧密程度，我们种植Thatcher×Lr37/6^*Thatcher杂交的F2代小麦128株，接种Lr37的无毒菌株，抗感比为3:1。提取其单株小麦的DNA，再以引物UBC812进行扩增，发现所有的抗病单株均能扩增出1200bp的特异性条带，而所有的感病单株没有此条带。表明标记UBC812-1200与Lr37基因共分离。