水资源是人类生存和发展的基础，是经济社会可持续发展的重要物质保障。随着我国经济社会的快速发展，水资源短缺、水污染和水生态环境破坏已成为制约我国经济社会可持续发展的重要因素，南水北调工程的实施是缓解我国北方地区水资源短缺、保证我国经济社会可持续发展的战略措施。 现代产权经济学认为，资源配置最有效的途径是通过市场和价格来实现，市场是合理配置资源的有效形式，解决水资源短缺最有效的手段就是建立水权交易市场。所以本论文结合南水北调东线工程的实际，建立了南水北调东线工程水市场运行管理体系，为在社会主义市场经济条件下，建立符合我国实际情况的水权水市场提供科学依据。本论文的主要内容如下： (1)水权的界定是水市场形成和运行的前提，所以本论文从产权经济学的角度出发，对可交易水权的概念和内涵进行界定，分析初始水权的分配，介绍国外水权制度及实践情况，以及我国水权制度现状； (2)面对日益增长的供水需求，有效的解决办法就是通过水权市场来重新分配现有的供给。所以根据国内外关于水市场的研究进展，总结分析水市场的分类、特点、水市场的构建模式以及水权交易等； (3)借鉴国内外水权交易的先进经验，结合南水北调东线工程的实际情况，研究南水北调东线工程水市场的建立，包括南水北调东线工程水市场框架的构建、水权交易的方式、范围、原则、程序、步骤等； (4)水资源的特殊属性决定了水市场只能是一个不完全的市场，是一个“准市场”，所以除了利用市场机制引导微观交易以外，还需要政府的宏观调控和监管。因此论文还研究了在社会主义市场经济条件下如何建立水市场的运行管理体系，以及如何转变政府职能，发挥政府的作用，逐步建立和完善水权交易市场。