我国民办高等教育从改革开放发展到现在,对我国高等教育的发展发挥了重要的作用。然而,随着经济发展,高校扩招,教育改革的不断深入,我国的民办高等院校发展遇到了很多体制问题与制度问题。在民办高校发展过程中,外部治理结构是否完善与合理对民办高校的发展影响和制约越来越大。针对上述问题,本文利用文献分析和比较分析等方法,根据我国国情和我国民办高等教育发展现状,分析了我国民办高等院校在发展过程中外部治理结构出现的问题以及形成原因。同时,提出了完善我国民办高等院校外部治理结构的措施,那就是合理定位政府的角色与职能,引入市场管理机制,加大社会参与度,发展我国民办高等教育中介组织,构建以政府为主导,民办高校为核心,社会主体广泛参与的民办高校外部治理结构,明确并优化政府、社会、市场和民办高等院校自身的角色与定位,促进政府、社会、高校的合理平衡,建立政府、市场、社会和民办高校之间的合作机制,制订行为规范,在资源的合理配置、权力合理共享的前提下实现彼此的利益,促使我国民办高校面向市场,面向社会,稳步健康可持续发展,为我国高等教育发展与经济建设贡献力量。