鸭瘟病毒CHv株UL54基因及其编码蛋白特性与基本功能研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:walter1i
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鸭瘟病毒(duck plague virus,DPV)属于疱疹病毒科、α-疱疹病毒亚科、马立克氏病毒属,其感染鸭、鹅等水禽,常造成严重的发病和死亡。与其它疱疹病毒相比,DPV分子生物学研究起步较晚,但发展迅速,目前多数基因的研究正在进行,而UL54基因及其编码蛋白在DPV致病过程中的具体作用尚属未知。因此本论文的主要目的是希望通过分析DPV UL54基因及其编码蛋白的特性与基本功能,帮助阐明DPV的致病机理。
  论文首先对DPV UL54基因进行生物信息学分析和多克隆抗体制各,并分别用实时荧光定量PCR和免疫印迹分析转录时相和表达时相;其次用间接免疫荧光法对UL54蛋白进行细胞内定位分析;然后采用种间异核体技术解析UL54蛋白的核质穿梭活性及其功能区;接着构建基于BAC的UL54基因缺失株和回复株并评价其基本生物学特性(包括生长曲线、空斑形成和病毒基因组DNA拷贝数);随后用实时荧光定量PCR分析UL54调控DPV其他基因的表达,并且分别基于核runoff试验、直接荧光原位杂交试验和核糖体-新生肽链复合物(RNC),研究UL54在DPV基因转录、mRNA出核、翻译过程中的作用;最后通过DAPI染核、HE染色、AnnexinⅤ-FITC/PI双染流式检测、Caspase-3相对表达水平和活性检测,研究DPV UL54对DEF细胞凋亡的影响。结果表明:①DPV UL54基因包含的完整ORF大小为1377bp,编码肽链由458个氨基酸组成,该肽链无信号肽和跨膜区,包含18个抗原表位;其密码子使用模式与大肠杆菌接近,除了编码Met、Glu和Trp的密码子外,其他氨基酸的密码子使用都存在偏嗜性,且第三位偏向使用A/T;UL54蛋白被预测出主要定位于细胞核,且包含1个核输出信号(NES)和多个核定位信号(NLS);②DPV UL54属于立即早期基因,编码蛋白分子量约57.0KDa;在病毒感染0.5/2h后能检测到,24h达到峰值;转录与表达的动态变化基本一致;③DPV UL54蛋白在2-8h主要定位于细胞质,12-36h逐渐进行细胞核,48h完全入核,60h后少量出现在细胞质;④DPV UL54蛋白具有核质穿梭活性;包含功能性NES,其对莱普霉素B(LMB)敏感,且对UL54蛋白自身定位没有显著影响;包含多个功能性NLS,其联合作用影响UL54蛋白自身定位;UL54蛋白入核对病毒复制、空斑形成、病毒基因组DNA复制和各时期病毒基因mRNA表达都有重要作用;⑤DPV UL54不是病毒复制必需的,但能促进病毒增殖、空斑形成和病毒基因组DNA复制;⑥DPV UL54正负双向调控UL19、UL30、UL48、gC、gD和gK基因mRNA表达:对UL19mRNA的调控以抑制为主;始终促进UL30和gC基因mRNA表达;对UL48和gD基因mRNA是早期抑制,中后期促进;对gK基因mRNA在感染早中期有促进或抑制作用;⑦DPV UL54早期抑制UL30基因的转录,始终促进其他时期的UL30和其他病毒基因的转录;⑧DPV UL54促进UL30基因mRNA的核输出;⑨DPVUL54在感染早期抑制UL19、UL30、UL48、gC、gD和gK的翻译,中后期促进;⑩DPV UL54对DEF细胞凋亡没有影响,且在DPV致DEF细胞凋亡效应中也没有显著作用。
  本论文对DPV UL54基因及其编码蛋白进行了系统研究,尤其是明确了UL54蛋白的核质穿梭活性和对病毒基因表达的调控作用。从分子水平阐明UL54在DPV致病中所起的作用,具有较大的理论意义和实用价值。
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