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第一部分 Leber遗传性视神经病变患者筛查及资料收集
目的:
1.在全国范围内收集视神经病变家系,建立临床资料和分子遗传学资料数据库。并收集194个无亲缘关系的正常人作为对照。
2.在收集的视神经病变家系及正常对照者中筛查与Leber遗传性视神经病变(Lebers hereditary optic neuropathy,LHON)相关的线粒体DNA(mtDNA)三个原发突变位点(G3460A、G11778A、T14484C),了解中国人群的突变频谱。
方法:
1.对收集的视神经病变家系采集血样,了解家系情况,并对试验对象进行详细的眼科临床检查,建立临床和分子遗传学资料数据库。
2.对采集的血样提取基因组DNA,并设计三对引物对包含三个原发突变位点的片段进行PCR扩增、纯化和测序。
3.使用各种生物软件(DNAStar、Chromas、Clustal X)分析测序结果,找出所有的多态性位点和突变位点,分析其对LHON表型表达的影响。
结果:
1.本课题组共收集到视神经病变家系690个,其中携带LHON三个原发突变位点的家系302个,包括G11778A突变家系255个、G3460A突变家系9个、T14484C突变家系38个。
2.对包含三个原发位点的片段筛查发现携带继发突变位点(G3316A、T3394C、C3497T、G3635A、G3733A、G11696A及A14693G)的家系共102个。
3.在194例正常对照者中携带T3394C突变位点的有2例。
结论:
1.中国人群中Leber遗传性视神经病变相关的原发突变发病频谱与白种人有所差异,G11778A突变比例较高,G3460A和T14484C突变所占比例较低。
2.G11778A合并T3394C的家系7个,T3394C不合并原发突变位点的家系9个,为研究T3394C突变对LHON表型表达的影响提供遗传资料基础。
第二部分线粒体 DNA T3394C突变可能影响Leber遗传性视神经病变家系的表型表达
目的:
1.了解三个携带mtDNA T3394C突变但不携带原发突变位点的LHON家系的临床表型、外显率和表现度,分析T3394C突变对LHON表型表达的影响。
2.了解两个携带mtDNA T3394C和G11778A双突变位点的LHON家系的临床表型、外显率和表现度,探讨T3394C突变在携带G11778A突变位点的LHON家系表型表达中的作用。
3.分析线粒体背景、核修饰基因、环境因素(吸烟、饮酒和心理因素等)对中国LHON家系外显率和表现度的影响。
方法:
1.对家系先证者及母系成员进行详细的眼科检查,详细询问并记录家族史。
2.以家系先证者基因组DNA为模板,使用24对有部分重叠的引物对先证者mtDNA全序列进行PCR扩增、纯化和测序。
3.使用各种生物软件(DNAStar、Chromas、Clustal X)分析测序结果,找出所有的多态性位点和突变位点,分析其对功能的影响。
结果:
1.五个家系都具有典型的LHON临床表现,WZ98、WZ99和WZ100家系中都仅有一个成员发病,外显率分别为5.9%、10%和8.3%,发病年龄分别为14岁、21岁和14岁,视力损伤程度从轻度、中度到重度不等。WZ102和WZ103家系中LHON的外显率为56%和38%,家系平均发病年龄分别为19岁和17岁,男女发病比例为1:1.5和3:0。
2.对先证者线粒体基因组测序发现这五个序列都存在许多mtDNA变异位点,WZ98、WZ99和WZ100家系未检测到G11778A、G3460A和T14484C三个常见的突变位点,但先证者和母系成员均存在ND1基因T3394C位点同质性突变。WZ102和WZ103家系同时存在G11778A原发突变位点及T3394C突变位点。
3.线粒体单体型分析这五个mtDNA序列分别属于亚洲单体型D4b2、M9a、M9a3M9a和M9a。
结论:
1.三个携带mtDNA T3394C突变但不携带原发突变位点的LHON家系中只有一个成员发病,在194例正常对照者中存在2例携带T3394C突变,这种低外显率和在正常对照者出现说明T3394C突变本身不足导致LHON的发生。
2.两个携带mtDNA T3394C和G11778A双突变位点的LHON家系外显率较高,分别为56%和38%,G11778A突变是其致病的主要因素。T3394C突变位于ND1基因进化保守区,它使ND1亚单位中第30位极性中性酪氨酸被碱性组氨酸取代,可能协同原发突变位点G11778A提高LHON的外显率。
3.先证者mtDNA序列分别属于亚洲单体型D4b2、M9a、M9a3、M9a和M9a,但未发现这些单体型对LHON的表型表达存在影响。
4.家系母系成员尽管携带有相同的mtDNA,但发病年龄和病情严重程度存在差别,表明核修饰基因、环境因素(吸烟、饮酒和心理因素等)可能影响LHON的表型表达。