【摘 要】
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燕麦（Avena L.）是禾本科燕麦属一年生草本植物,是世界性栽培作物和重要的粮饲兼用作物。春、夏播燕麦是长日照作物,光周期不敏感燕麦的创制使其在短日照条件下能正常生长发育。PRR基因是光周期途径中重要的昼夜节律调节基因。前期转录组研究表明PRR基因可能与燕麦光周期不敏感性有关。本研究在转录组水平对燕麦PRR基因家族进行鉴定和生物信息学分析,并对AsPRR37基因进行了克隆和分析,结果如下:1.在
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燕麦（Avena L.）是禾本科燕麦属一年生草本植物,是世界性栽培作物和重要的粮饲兼用作物。春、夏播燕麦是长日照作物,光周期不敏感燕麦的创制使其在短日照条件下能正常生长发育。PRR基因是光周期途径中重要的昼夜节律调节基因。前期转录组研究表明PRR基因可能与燕麦光周期不敏感性有关。本研究在转录组水平对燕麦PRR基因家族进行鉴定和生物信息学分析,并对AsPRR37基因进行了克隆和分析,结果如下:1.在转录组水平鉴定到31个PRR基因的转录本,包含6个基因,其编码氨基酸的N端含有REC保守结构域,在C端含有CCT保守结构域;无规则卷曲所占比例较大,其次是α螺旋,延伸链与β-转角所占比例较小;多数成员为不稳定的亲水性蛋白,等电点在4.86～9.95之间;PRR家族磷酸化位点大多是苏氨酸和酪氨酸。进化分析表明燕麦AsPRR37基因编码的氨基酸序列与小麦Tr PRR的氨基酸一致度最高。2.克隆得到了光周期不敏感材料gp012中AsPRR37基因组DNA序列,长度为3985bp,包含9个外显子和8个内含子,定位于6A染色体上,与燕麦基因组中该序列一致性为96.15%,序列差异包括63个SNP和13个Indels。
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