水稻第6染色体短臂产量性状QTL的分解与遗传验证

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本实验室前期利用珍汕97B/密阳46重组自交系群体,经初步定位,发现第6染色体短臂上的QTL对研究群体的产量形成具有重要作用。经548个SSR标记检测,两亲本在47.8%的座位上呈多态。本研究选取第6染色体短臂目标区间多态性标记8个和其它区间标记18个,检测461个F7株系各1个单株,筛选出一个在RM587-RM402区间(约4.1Mb)呈杂合,在其他区间呈纯合的单株。进而以208个多态性SSR标记检测该单株,结果发现该单株除了在第6染色体短臂RM587-RM19784约7.3Mb区间呈杂合,还在第1染色体长臂RM488-RM3336约3.8Mb区间、第2染色体长臂RM5916-RM208约1.1 Mb区间、第4染色体短臂RM16252-RM16355约2.0Mb区间、第5染色体短臂RM267-RM5874约0.6Mb区间呈杂合。但同一组合的前期研究未在这些背景区间检测到产量性状QTL,这说明背景杂合区间对目标区间产量QTL定位的影响较小。利用该单株衍生了一套由221个株系组成的F2:3群体,建立SSR标记连锁图分解产量性状QTL,并进而由此群体衍生了4个次级RHL衍生群体,进行进一步的验证和分解。主要结果如下:1.应用原始RHL衍生的F2:3群体,发现完整目标区域中(即RM587-RM19784)存在3个以上控制产量性状的区间。将由221个株系组成的F3群体,种植于海南和浙江两地,考察每株穗数、每穗实粒数、每穗总粒数、千粒重、结实率和单株产量,应用Windows QTL Cartographer 2.5检测QTL,分解水稻第6染色体短臂上控制产量性状的QTL。结果表明,在所分析的6个性状中,除穗数外均在第6染色体短臂上的目标区间均检测到QTL,分别座落于目标区域中3个以上的不同区间中,单个QTL对群体性状表型变异的贡献率为6.3%~35.2%;控制产量构成因子的QTL基本以加性作用为主;同一区间控制不同性状的QTLs、不同区间控制同一个性状的QTLs在遗传作用模式、效应方向和效应大小上存在一定差异。2.应用覆盖目标区域中RM587-RM402区间的三套近等基因系材料,分解出3个控制产量性状的QTL,分别位于0.66~2.49Mb的区间中。从上述F3群体中筛选获得三套次级RHL,针对RM587-RM402区间,构建了三套近等基因系。经等位基因效应分析和交迭重组染色体片段代换系分析,分解出3个控制每穗实粒数的QTLs和2个控制单株产量的QTLs,这些QTLs分别位于物理距离为0.66~2.49Mb的区间中,全部表现为加性作用为主,增效等位基因除qNFGP6-1来自父本密阳46外,均来自母本珍汕97B。提出了构建新型遗传材料、提高水稻QTL精细定位效率的策略。3.应用覆盖RM111—RM19784区间的次级RHL衍生群体,验证了目标区域底部产量性状QTL的作用。从原始F3群体筛选出在RM111—RM19784区间杂合,其他区间纯合的一个RHL,自交获得484个F2单株,经标记检测后挑选在目标区间发生重组的134个株系和不发生重组的20个株系,种植其F3群体。经分析,在6个产量性状上都在目标区间底部或近底部区域检测到显著的效应。这些OTLs全部表现为加性作用为主,单个QTL对群体性状表型变异的贡献率为11.93%~76.38%,最大LOD值坐落于RM19706-RM19784之间。
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