21世纪以来，以电子技术，计算机技术为代表的信息技术的飞速发展使国民经济和社会生产生活的各个方面得到了空前的改变。信息产业正成为当今世界经济增长的主要推动力，而软件业作为信息产业的核心和灵魂，已成为信息产业不可或缺的重要组成部分。伴随着我国经济市场化和国际化程度的提高，软件企业所面临的竞争更加激烈，加之软件产品周期短、复制成本低、客户转化成本高，因此软件企业的经营效率显得至关重要，提高软件产品生产的效率成为急需思考的问题。但我国软件公司的经营效率究竟如何，哪些因素影响和制约了我国软件公司的经营绩效，关于这方面的研究文献较少，仅有的研究也大多从宏观层面出发，基于传统DEA模型和整个软件产业来进行效率评价，很少有相关文献具体到软件公司进行效率评估，针对软件上市公司经营效率影响因素的研究更是少之又少。本文以我国泸深两市上市的29家软件公司为代表，首先利用基础DEA对样本软件公司2008-2011年间的相对效率进行了测度与分析，进一步采用超效率DEA模型对相对有效的单元进行排序与比较，然后利用malmqusit指数法对我国软件行业2008-2011年的全要素生产率进行了动态分析，最后运用DEA-Tobit两阶段模型就技术创新能力、股权集中度以及企业规模与公司经营效率的关系进行了实证研究。研究结果表明：我国上市软件公司投入产出效率整体不高，且大多数无效软件公司均存在不同程度的投入冗余和产出不足；从整体来看，整个软件行业近四年的平均全要素生产率呈现增长态势，且主要得益于生产技术的进步和创新；从影响因素来看，研发资金投入强度与企业经营效率显著正相关；研发人员投入强度对公司经营效率影响不显著；股权相对集中（股权适度集中且有较好的股权制衡度）对公司经营效率有显著的正向影响；企业规模在一定程度上会促进经营效率的提高。最后，就分析结果提出相应的政策建议：注重技术创新，着力提高资源转换效率；优化资源配置，增强组织运营管理能力；加大科研投入力度，重视人才培训。