长链非编码RNA在青少年特发性脊柱侧凸椎旁肌中的表达差异性研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yhl0921
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研究背景:特发性脊柱侧凸(Idiopathic Scoliosis, IS)是一种发病率高(发病率1-3%)[1],严重影响生命质量的疾病,大约占脊柱侧凸发病总数的80%。根据发病年龄的不同分为婴幼儿特发性脊柱侧凸(Infantile Idiopathic Scoliosis, IIS)(0-3岁)、少儿特发性脊柱侧凸(Juvenile Idiopathic Scoliosis,JIS)(3-9岁)、青少年特发性脊柱侧凸(Adolescent Idiopathic Scoliosis,AIS)(10-16岁)。其中AIS在特发性脊柱侧凸患病人群中占约80%。AIS的病因学尚未明确,目前对其发病机制的描述有多种假说,但都无法很好地解释AIS的发生。已有的研究表明AIS的发生具有明显的遗传倾向[2]。国内外在对其基因组学的、蛋白质组学等方向的大量研究虽己取得一定的成绩,但结论并不一致,无法很好地对AIS的发生、进展做出满意的解释。在对人类庞大的基因信息不断认识之中,别于传统编码蛋白的基因,非编码基因序列逐渐被人们所认识,并开始呈现在一些疾病机制中的重要作用。长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)就是其中的一种,它是真核细胞中一类转录本长度超过200nt的不具有蛋白编码功能RNA分子[3]。目前的研究不断发现lncRNA复杂的作用机制与功能,其通过作为基因信息与其产物之间调控者,对人类的众多疾病的发生发展起着重要作用。本研究以lncRNA为主要研究对象,通过运用基因芯片技术在外周血中所挑选的lncRNA,对其在肌肉组织中进行实时定量PCR检测表达水平,从长链非编码RNA这一新视角进行探索,期待对AIS的发病机制有一些新的认识。研究目的:通过对从AIS外周血中用基因芯片技术所挑选的lncRNA在AIS患者及对照组椎旁肌中表达水平的进行分析,研究lncRNA在椎旁肌中转录水平上的差异性,探讨其可能的发病机制。研究方法:1.通过对4例青少年特发性脊柱侧凸患者以及4例年龄、性别匹配的正常对照人群的外周血。利用gilent human lncRNA+mRNA Array V3.0微阵列芯片技术筛选出有表达水平差异性的并且在功能上可能影响肌肉、骨骼系统的lncRNA。2.通过收集AIS患者(21例)及对照组(4例)的椎旁肌肉,对所筛选出来的lncRNA进行qPCR检测其在椎旁肌中表达水平。研究结果:1.通过基因芯片技术及Pathway分析、GO(Gene ontology)分析、及lncRNA和mRNA的共表达网络构建,筛选了ENST00000602322.1、 HIT000067310、ENST00000440778.1、ENST00000414894.1、TCONS00028768共5条在AIS患者外周血中存在差异性表达且在功能上与肌肉、骨骼相关的lncRNA。2.在AIS患者及对照组椎旁肌中对所筛选出来的lncRNA进行表达水平的检测,发现在AIS患者中ENST00000602322.1、HIT000067310、 ENST00000440778.1、ENST00000414894.1、TCONS00028768共5条lncRNA的表达水平较对照组均有不同程度的降低(P<0.05);3.在病例组及对照组自身椎旁肌的左侧与右侧的对比中,发现ENST00000602322.1. HIT000067310、ENST00000440778.1、 ENST00000414894.1、TCONS00028768共5条lncRNA表达水平无明显差异性(P<0.05);4.在对AIS患者组通过月经初潮年龄、Risser征分度、Cobb角分组后,发现ENST00000440778.1及TCONS00028768在月经较早组(≤12岁)椎旁肌的表达水平较低(P<0.05); ENST00000602322.1在骨骼发育较程度较高组(Risser>I)中的表达水平低(P<0.05)。HIT000067310在Cobb角<47的患者中表达水平较低(P<0.05)。研究结论:1.本研究发现ENST00000602322.1、HIT000067310、 ENST00000440778.1、ENST00000414894.1、TCONS00028768在AIS患者椎旁肌中的表达水平降低;2.上述lncRNA在AIS患者自身椎旁肌凹凸侧的表达水平不存在差异性;3.在AIS不同的临床表现人群中,上述lncRNA在椎旁肌中的表达水平存在差异性
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