圆盘菌无性型属的分子系统发育及其DNA条形码研究

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圆盘菌科(Orbiliaceae)真菌具有重要的生态学意义和经济价值,该科真菌包含了几个重要的捕食线虫丝孢菌无性型属,如Arthrobotrys、Dactylellina、 Drechslerella等。但因该科真菌包含无性型属种多,物种形态特征多样,某些物种间没有明显的显微结构差异,且目前对该类真菌的分子系统发育研究不足,故研究者对该类真菌分子系统发育及物种鉴定等方面的问题争议不断。本研究选取了7个基因片段,构建了多基因联合的系统发育树解析圆盘菌无性型真菌各属级支系和物种之间的亲缘关系,并通过对序列获得难易程度,物种种间和种内遗传距离的计算,物种识别能力等3个方面的评估了各个基因片段作为圆盘菌科无性型DNA条形码的可行性。主要结果如下:1.本研究覆盖5个圆盘菌无性型属真菌:其中三个捕食线虫丝孢菌属Arthrobotrys, Dactylellina, Drechslerella,两个非捕食真菌属Dactylella和Pseudotripoconidium共计66个已发表种,138个菌株。总计得到圆盘菌无性型属真菌可用DNA序列866条,并联合NCBI数据库中相关序列,首先以ITS序列做初步鉴定和系统发育分析,并联合RPB2、TUB、TEF等3个片段进行系统发育研究,在3个捕食线虫丝孢菌属中共发现31个新的系统学种,极大的丰富了圆盘菌无性型属中捕食线虫丝孢菌的生物多样性;2.依据ITS系统发育树和多基因联合分析结果,发现了7个在属级水平上出现分类错误的菌株。而在种水平的分析中,将6个种合并入与其系统发育关系近且清晰的种中;3.通过对序列获得难易程度,物种种间和种内遗传距离的计算,物种识别能力等3个方面的评估,认为RPB2基因的扩增和测序成功率适中,其单基因系统树与多基因联合分析的系统树拓扑结构最相似,物种识别能力最高,且以K2p模型计算种内种间遗传距离结果发现,只有RPB2存在隔离,其余片段均表现为有较大尺度的重叠。故研究建议以RPB2作为ITS的候补基因,将二者作为圆盘菌无性型属的DNA条形码。
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