枣(Ziziphus jujube Mill.)原产我国，属鼠李科（Rhamnaceae）枣属(Ziziphus Mill.)植物。安徽省枣种质资源丰富，遗传背景非常复杂，在前人的研究中，枣的分类已经涉及到形态学、抱粉学、生物化学、分子生物学等领域，经历了从形态多样性到DNA多样性的发展过程。分类标准的不统一和分类手段的局限性，导致分类结果各不相同。造成品种来源不够清晰以及亲缘关系很不明确，致使枣的同物异名及同名异物现象十分普遍，这些都不利于枣种质资源的研究、优良品种的选育与推广。本研究通过ISSR标记和形态标记方法，对85个枣种质资源的亲缘关系、遗传多样性进行了系统分析，目的在于揭示我国枣种质资源多样性，为枣的分类、遗传育种和种质资源保存提供了有力证据，主要研究结果如下:1、通过正交设计，建立了枣ISSR-PCR最佳反应体系（25ul）：1.0U Taq DNA聚合酶、2.5mmol/L MgCl2、0.20mmol/L dNTPs、0.30μmol/L引物、20-80ng模板DNA。其中Mg2+浓度和dNTPs浓度是影响ISSR-PCR反应的主要因素。2、从32条随机ISSR引物中筛选出26条扩增条带清晰、多态性好的引物对85份枣种质资源进行扩增分析，共扩增出255条电泳谱带，平均每对引物产生8.79条谱带，其中240条为多态性带，多态性比率为94.12%；其余15条谱带为所有材料共有，占5.88%。供试样品间的遗传相似系数在0.4863～0.9490之间。肥东圆枣与肥东铃枣之间遗传相似系数最大，为0.9490；宣城圆枣与铜钱树之间，以及山东梨枣与铜钱树之间的遗传相似系数最小，均为0.4863。3、采用UPGMA法对供试85份材料的ISSR数据进行聚类分析，聚类分析的结果与枣的地理来源有密切关系，来自山东的疙瘩脆、六月鲜和孔府酥脆枣都聚到了一起。但来自不同地区的部分枣品种在聚类图中没有明显界限，这可能是因为枣品种的起源和亲缘关系较为复杂，也可能是地区之间枣品种的广泛交流造成的。4、对安徽枣品种间进行扩增分析。34个安徽品种共扩增出223条电泳谱带，其中190条为多态性带，多态性比率为85.20%。供试样品间的遗传相似系数在0.6392～0.9490之间。肥东铃枣与肥东圆枣之间遗传相似系数最大，为0.9490，其次是繁昌小冬瓜枣与皖南冬瓜枣，为0.9373；繁昌小冬瓜枣与宣城圆枣之间遗传相似系数最小，为0.6392，其次是皖南冬瓜枣与宣称圆枣之间，为0.6549。5、首次对安徽地方枣品种和周边地区枣品种的群体遗传多样性进行了研究。比较了安徽地方枣与北方枣2个样本群的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数（na）、有效等位基因数(ne)、Nei’s遗传多样性指数(h)和Shannon’s信息指数(I)等遗传多样性相关参数。基于Nei’s遗传距离对2个样本群进行了UPGMA聚类分析。