ASIP、KIT和STX17基因多态性与驴毛色的相关性研究

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wjc_0758
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毛色是驴品种识别的重要依据之一,驴毛色分为黑色、灰色、白色等。本试验以中国驴为研究对象,采用PCR扩增、测序与PCR-RFLP方法,研究ASIP基因、KIT基因和STX17基因多态性与驴毛色的相关性,获得了以下新的结果:(1)发现中国驴ASIP基因编码区第三外显子存在c.349 T>C突变,且该突变可以区分纯黑色驴(CC型)和非黑色驴(TT型或TC型);在13个中国地方驴品种共590个样本中,纯黑色驴(CC型)占0.080,非黑色驴(TT型或TC型)占0.920;利用ASIP基因的PCR-RFLP技术可以把纯黑色驴与非黑色驴区分开,简单实用,可以作为黑色驴早期选种的分子标记。(2)在驴KIT基因外显子8检测到1个SNP g.64649 A>G(同义突变),外显子21检测到1个SNP g.79646 A>C(错义突变),导致其编码的氨基酸由谷氨酸(Glu)突变为脯氨酸(Pro),在5’UTR区检测到1个SNP g.69 C>A,在3’UTR区检测到1个SNP g.79948 C>T,在KIT基因起始密码子上游-1857 bp处检测到一个SNP g.-1857 C>T,在KIT基因内含子区检测到41个SNPs,在内含子3检测到4个碱基缺失,但KIT基因这些SNPs不能将不同毛色的驴区分开,表明这些SNPs与驴的不同毛色表型无相关性。(3)在部分驴STX17基因第6内含子上可能存在1.2 kb左右的插入片段;在驴STX17基因外显子区不存在SNPs,但在其第6内含子上发现2个SNP位点,均与驴毛色表型无相关性。
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