本文以2012-2014年沪深A股上市公司为研究对象,探讨内部控制在股权结构影响企业财务绩效过程中所发挥的作用,运用统计软件SPSS19.0进行了实证分析。以内部控制为核心,从股权集中度、股权制衡度以及股权性质三个方面衡量上市公司股权结构,与此同时,运用定性分析选取财务指标构建企业财务绩效评价体系,并通过因子分析对企业财务绩效进行综合评价打分,以此对财务绩效进行衡量,检验了内部控制对股权结构与企业财务绩效的中介效应。实证结果显示:(1)股权集中度与企业财务绩效显著正相关,即股权集中度越高,企业财务绩效越好;股权制衡度也与企业财务绩效显著正相关,即企业股权制衡能力越强,财务绩效越好;股权性质则与企业财务绩效显著负相关,即国有企业具有较差的财务绩效。(2)股权集中度、股权制衡度以及股权性质与内部控制均为显著正相关关系,即较高的股权集中度与制衡度对内部控制起到积极作用,股权性质为国有时,企业内部控制水平更高。(3)内部控制在股权集中度与企业财务绩效之间发挥了部分中介效应,同时也在股权制衡度影响企业财务绩效的过程中存在部分中介效应,但在股权性质与企业财务绩效之间发挥的间接效应不显著。最后,根据实证分析结果,提出了相关建议。