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目的:检测KIAA1267(KAT8regulatory NSL complex subunit1)和PRH1(proline-rich protein HaeⅢ subfamily1)基因拷贝数变异(Copy number variations, CNVs)在人群中的发生率,探讨其与先天性心脏病的相关性。方法:本研究以散发的330例先天性心脏病(Congenital Heart Disease, CHD)患儿和一个CHD家系、300例正常对照为研究对象,采用实时荧光定量PCR(Real-time Polymerase Chain Reaction, Real-time PCR)技术对前期实验中采用微阵列比较基因组杂交芯片(array-based Comparative Genomic Hybridization, aCGH)筛选出的候选基因KIAA1267和PRH1扩大样本量进行验证,检测其在人群中拷贝数变异情况及发生率,并进行统计学分析。结果:1.散发性先天性心脏病患儿样本KIAA1267基因拷贝数检测及统计分析:(1)330例先天性心脏病患儿样本经KIAA1267-1、KIAA1267-2两对引物检测及三复孔验证,确定检出8例样本在KIAA1267基因区域有片段缺失,322例样本未见拷贝数异常。正常对照组300例样本在KIAA1267基因区域均未检出片段缺失。(2)对检测出有片段缺失的8例阳性样本采用KIAA1267-3和KIAA1267-6引物进行边界定位,发现8例样本存在大小不等的片段缺失,其中编号为10HD173-1和10HD318-1的样本在引物KIAA1267-2所在区域附近还存在多拷贝的变异,即缺失和扩增并发。(3)先天性心脏病实验组KIAA1267基因拷贝数变异率大于正常对照组(X2=0.008,P<0.01)2.散发性先天性心脏病患儿样本PRH1基因拷贝数检测及统计分析:(1)采用PRH1-2引物(扩增片段位于PRHl基因上游)进行检测,在200例先天性心脏病患儿样本中检出零拷贝59例(29.50%),单拷贝23例(11.50%),双拷贝98例(49.00%),多拷贝20例(10.00%);于120例正常对照样本中检出零拷贝14例(11.67%),单拷贝23例(19.17%),双拷贝77例(64.17%),多拷贝6例(5.00%)。对两组样本的检测结果根据拷贝数情况分为四个等级进行统计,并运用统计软件SPSS17.0进行两独立样本等级资料比较的秩和检验,得出Z=-4.386,P<0.01,具有显著差异,即先天性心脏病实验组PRHl基因拷贝数变异率大于正常对照组。(2)经三复孔验证及PRH1基因上游序列的引物PRH1-3、PRH1-4验证,与以上实验结果相同。(3)对上述实验检测结果为单拷贝的阳性样本用PRH1-5引物(扩增片段位于PRHl基因内)进行检测,结果全部为双拷贝。3.先天性心脏病家系两基因检测情况:(1)CHD家系中四人(Ⅰ1、Ⅰ2、Ⅱ2、Ⅱ3)在KIAA1267基因区域均未检出片段缺失或扩增。(2)家系中Ⅰ2、Ⅱ2样本基因组DNA在以PRH1-2为引物的实验中为零拷贝,Ⅰ1、Ⅱ3则为单拷贝;在以PRH1-5为引物的实验中四人均为双拷贝。结论:1.KIAA1267基因经检测及统计学分析,提示两组样本实验结果有显著差异(X2=0.008,P<0.01),考虑KIAA1267可能是先天性心脏病的风险因子之一2.PRH1基因经检测及统计学分析,提示两组样本实验结果有显著差异(Z=-4.386,P<0.01),考虑PRH1基因上游序列拷贝数变异可能会增加先天性心脏病的发病风险。3.针对PRH1基因上游序列存在缺失而基因内未见缺失这一情况,考虑其致病机制可能与上游序列影响基因表达的调控过程有关,但确切相关性有待进一步研究。