KIAA1267和PRH1基因拷贝数变异与先天性心脏病相关性的研究

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jodan2008tw
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:检测KIAA1267(KAT8regulatory NSL complex subunit1)和PRH1(proline-rich protein HaeⅢ subfamily1)基因拷贝数变异(Copy number variations, CNVs)在人群中的发生率,探讨其与先天性心脏病的相关性。方法:本研究以散发的330例先天性心脏病(Congenital Heart Disease, CHD)患儿和一个CHD家系、300例正常对照为研究对象,采用实时荧光定量PCR(Real-time Polymerase Chain Reaction, Real-time PCR)技术对前期实验中采用微阵列比较基因组杂交芯片(array-based Comparative Genomic Hybridization, aCGH)筛选出的候选基因KIAA1267和PRH1扩大样本量进行验证,检测其在人群中拷贝数变异情况及发生率,并进行统计学分析。结果:1.散发性先天性心脏病患儿样本KIAA1267基因拷贝数检测及统计分析:(1)330例先天性心脏病患儿样本经KIAA1267-1、KIAA1267-2两对引物检测及三复孔验证,确定检出8例样本在KIAA1267基因区域有片段缺失,322例样本未见拷贝数异常。正常对照组300例样本在KIAA1267基因区域均未检出片段缺失。(2)对检测出有片段缺失的8例阳性样本采用KIAA1267-3和KIAA1267-6引物进行边界定位,发现8例样本存在大小不等的片段缺失,其中编号为10HD173-1和10HD318-1的样本在引物KIAA1267-2所在区域附近还存在多拷贝的变异,即缺失和扩增并发。(3)先天性心脏病实验组KIAA1267基因拷贝数变异率大于正常对照组(X2=0.008,P<0.01)2.散发性先天性心脏病患儿样本PRH1基因拷贝数检测及统计分析:(1)采用PRH1-2引物(扩增片段位于PRHl基因上游)进行检测,在200例先天性心脏病患儿样本中检出零拷贝59例(29.50%),单拷贝23例(11.50%),双拷贝98例(49.00%),多拷贝20例(10.00%);于120例正常对照样本中检出零拷贝14例(11.67%),单拷贝23例(19.17%),双拷贝77例(64.17%),多拷贝6例(5.00%)。对两组样本的检测结果根据拷贝数情况分为四个等级进行统计,并运用统计软件SPSS17.0进行两独立样本等级资料比较的秩和检验,得出Z=-4.386,P<0.01,具有显著差异,即先天性心脏病实验组PRHl基因拷贝数变异率大于正常对照组。(2)经三复孔验证及PRH1基因上游序列的引物PRH1-3、PRH1-4验证,与以上实验结果相同。(3)对上述实验检测结果为单拷贝的阳性样本用PRH1-5引物(扩增片段位于PRHl基因内)进行检测,结果全部为双拷贝。3.先天性心脏病家系两基因检测情况:(1)CHD家系中四人(Ⅰ1、Ⅰ2、Ⅱ2、Ⅱ3)在KIAA1267基因区域均未检出片段缺失或扩增。(2)家系中Ⅰ2、Ⅱ2样本基因组DNA在以PRH1-2为引物的实验中为零拷贝,Ⅰ1、Ⅱ3则为单拷贝;在以PRH1-5为引物的实验中四人均为双拷贝。结论:1.KIAA1267基因经检测及统计学分析,提示两组样本实验结果有显著差异(X2=0.008,P<0.01),考虑KIAA1267可能是先天性心脏病的风险因子之一2.PRH1基因经检测及统计学分析,提示两组样本实验结果有显著差异(Z=-4.386,P<0.01),考虑PRH1基因上游序列拷贝数变异可能会增加先天性心脏病的发病风险。3.针对PRH1基因上游序列存在缺失而基因内未见缺失这一情况,考虑其致病机制可能与上游序列影响基因表达的调控过程有关,但确切相关性有待进一步研究。
其他文献
小岛信夫是日本战后文学的代表作家之一。岐阜县出身的小岛从高中时代起就酷爱文学,于东京帝国大学学习期间曾与冈本谦次郎等人创办杂志《崖》,并相继发表了《往返》《公 Ko
一 文化和中国传统文化rn文化的概念是指一切与政治、经济、科技、艺术、风俗、宗教、建筑、历史、国家、民族等有关的精神和知识的总和.中国传统文化就是中国历史发展过程中
期刊
期刊
为了研究海水深20m处空化器的空化特性,本文对120°锥角水下空泡清洗器在不同来流速度下进行了数值模拟.选取了来流速度为20m/s、40m/s和60m/s三个工况,在Fluent中计算得到了
学校博物馆多在显著位置展示校史.校史提供了丰富的编写校本教材的史料.这些史料蕴含着学校的光荣传统和教育教学成果,是编写校本教材的宝藏.要选取史料来编写校本教材,要以
期刊
期刊
目的:急性高原病(Acute mountain sickness,AMS)严重影响我国青藏高原移居人群的健康,目前尚无有效的防治方法。通过对由平原进入高原人群在平原及高原状态下心率、经皮血氧
在线教育博士是互联网技术与博士研究生教育的耦合,创新了博士研究生教育的培养模式.约翰·霍普金斯大学在线教育博士的培养以学术型实践者为目标,实行综合评价的入学标准,采
[目的]:  通过Meta分析探究睡眠时间与高血压发病风险的关系,为高血压的防治提供依据。  [方法]:  通过计算机检索多个电子数据库,包括EMBASE、PubMed、Cochrane、中国知网