本文主要以高校新校区建设中的内审部门的跟踪审计工作为研究对象，根据真实性、合法性和效益性的审计目标，系统构建了高校基建项目全过程跟踪审计工作体系。 文章首先分析了高校基建项日跟踪审计的实施特点及理论依据。通过与全过程造价控制比较得出跟踪审计的特征，并从信息论、系统论、控制论角度对跟踪审计进行了理论分析；通过分析建设项目审计相关规定，明确了跟踪审计实施的法律依据，旨在提高项目参与各方对跟踪审计的认识； 其次，通过分析高校基建项目的特点及现阶段高校跟踪审计工作中存在的问题，论述了构建跟踪审计工作体系的必要性，在分析高校内审机构的特点、职能与工作目标之后，进行了跟踪审计工作体系组织架构，合理配备项目跟踪审计人员的同时，对相关单位职责进行了定位； 然后，通过对工程前期阶段、施工阶段和竣工验收阶段跟踪审计工作内容的分析研究，详细论述了跟踪审计工作体系的实施。在工作组织架构基础上，完整构建了适合高校基建项目的跟踪审计工作体系； 最后，对高校基建项目跟踪审计工作进行了简单的效益与风险分析，进一步论证了该工作体系的优越性。