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目的MtDNA呈母系遗传,是群体遗传学研究理想的遗传标记物之一。利用直接测序的方法对毛发、白骨、腐败组织等人源性疑难生物检材的mtDNA多态检验,在案件的侦破中发挥着重要的作用。家犬是与人类关系最为亲密的动物之一,其数量与日俱增,与家犬有关的案件时有发生。运用mtDNA测序法建立犬科动物毛发mtDNA高变区Ⅰ(HVR-I)多态的检测方法,探讨家犬与狼、不同品种家犬mtDNA单倍型及其相互关系,为涉及此类检材案件的侦办服务。方法采集了拉布拉多犬、史宾格犬、德国牧羊犬、罗威纳犬、藏獒、杜伯文犬、金毛寻猎犬、昆明犬和昆明本地犬9个品种,共107只及2只狼无关个体的毛发。采用Investigator试剂盒(QIAamo公司,德国)方法提取毛发样本的mtDNA.用巢式PCR和直接测序进行mtDAN HVR-I测序检测。运用)NAStar和Arlequin等软件进行数据统计分析。结果107只家犬和2只狼的毛发样本mtDNA HVR-I扩增的片段长643bp。家犬中共检出27个多态点,多态位点的百分率为4.20%,多态点中以碱基转换为主占25个,颠换的位点有1个,未检见插入和缺失。昆明本地犬多态性位点最多有21个,其次是拉布拉多和昆明犬分别有18和17个多态性位点。碱基序列组成比率分别是26.76%(C)、30.19%(T)、27.38%(A)、15.67%(G)。根据上述多态点共界定A、B、C和F四个大的单倍群,21个单倍型,其频率从0.94%-20.60%,其中单倍型A11的频率最高。单倍型多样性为0.898,平均核苷酸差异为5.66±2.74,平均核苷酸多样度为0.0088±0.0047。在昆明犬和昆明本地犬都检测出有9个单倍型,昆明犬的单倍型多样性最高为0.847,其次为昆明本地犬,其单倍型多样性为0.842。两只狼的序列提交到美国国立生物技术息中心(NCBI)盲比结果为狼,其多态位点有两个不同。结论本研究获取的犬科动物mtDNA HVR-I群体遗传学基础数据,表明犬科动物mtDNAHVR-I有丰富的多态位点；家犬与狼的mtDNA单倍型分型不相同,不同犬种与mtDNA单倍型无关联,利用犬毛mtDNAHVR-I的多态性及其单倍型多样性为相关案件侦查提供线索或依据。