在京津冀协同发展的今天,首都地区的环境问题与周边贫困地区之间的矛盾日益突出,区域间的发展不平衡愈来愈严重。环首都贫困地区为了使京津冀地区享受到良好的环境服务,付出了巨大的代价,牺牲了许多发展机会。因此,不解决好环首都贫困地区的经济、民生问题就很难体现出公平原则,与协同发展相背离。要解决好此问题就须借助生态补偿的方法,来缓解区域间发展的不均衡,达到共同富裕的目标,对区域间经济发展有重要的意义。本文在京津冀协同发展的背景下,基于各个地区的发展功能定位,以理论与实践相结合进行分析研究。首先,从环京津贫困地区的贫困现状入手,分析出现阶段环首都贫困地区贫困的原因,指出生态补偿的缺位是环首都贫困地区贫困的重要原因之一,然后根据环首都贫困地区生态补偿实践过程中存在的问题来进行建议,针京津冀跨区域的生态补偿模式,可以通过京津冀三地政府协同补偿、政府与市场协同补偿、政府与第三方协同补偿三种方式来进行补偿,通过这种手段来实现区域间经济效益、生态环境效益、社会效益三种效益向良好的方向发展。在理论和实践两方面对该区域进行跨行政区域生态补偿问题进行了探讨,以期为我国主体功能区划分和不同行政区域之间的生态补偿在学术研究和实际操作的层面能够提供参考。