目的：比较242例重型手足口患儿肠道病毒COA16、EV71及其他肠道病毒三组不同病原感染的临床特点,为临床对重型手足口病的诊断及治疗提供参考。方法：收集2012年4月至2013年4月于遵义医学院附属医院儿科住院的重型手足口患儿咽拭子或肛拭子标本,利用RT-PCR技术检测肠道病毒COA16、EV71及其他肠道病毒；并严密观察临床表现,包括持续高热、神经系统症状、呼吸异常(频率)、循环障碍、肺出血及血糖、外周血白细胞计数等症状、体征及辅助检查结果,分析三组不同病原所致手足口临床表现的特点及预后的不同。结果：(1)病原学分类：242例重型手足口患儿中,EV71感染58例(24.0%), COA16感染136例(56.2%),两者同时感染12例(5.0%),其他肠道病毒36例(14.9%)。(2)三组病毒感染的临床特点：三组感染所致重症手足口病患儿均表现有呼吸异常、血糖升高及外周血白细胞计数升高,而EV71感染组患儿出现神经系统损害、循环功能障碍及肺出血较COA16组及其他肠道病毒感染组机率高。结论：EV71感染所致的重型手足口患儿易发生神经系统损害、循环功能障碍及肺出血,需提高警惕,早期治疗及干预。