乙型肝炎病毒全长基因扩增技术的建立及其在探讨宫内传播机理中的初步应用

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目的 乙型肝炎病毒(HBV)基因组具有很高的变异性,许多HBV携带者个体内都存在不同的HBV基因株(即多样性或异质性),不同株的病毒复制水平、免疫原性和传播特点等均不同,对疾病的发展和转归的影响也不同。为清晰的了解HBV基因在母婴体内异质性的具体状况,探索HBV基因变异与宫内传播的关系,本研究建立了乙型肝炎全长聚合酶链反应(Full-length PCR),可以直接从血清中一次克隆HBV全基因,在此基础上,对HBsAg阳性孕妇及其新生儿体内HBV前S/S基因进行了序列分析。 方法①2000年1月至6月收集西京医院检验科检测HBV DNA阳性的乙型肝炎患者血清10例,提取HBV DNA后,建立全长聚合酶链反应,并进行PCR条件优化。 ②PCR产物回收纯化后克隆入载体,获得HBV全长基因克隆,同时用PCR、酶切及测序三种方法对其进行鉴定。 ③1997~1998年,由王素萍博士收集太原市传染病院妇产科HBsAg阳性足月分娩产妇静脉血及其新生儿出生后24小时内股静脉血共50对,用新建立的HBV全长扩增方法成功扩增HBsAg阳性孕妇HBV DNA共8例,其中发生宫内传播者4例,未发生宫内传播者4例,并获得HBV全长基因克隆,然后对其前S/S区扩增并测序,其序列分析采用MEGLINE和VECTER NTI软件。 ④从2例新生儿血清标本中提取HBV DNA,对其进行HBV前S/S区基因扩 $·ftLt4+WI 增并测序,结果与其母亲、其它HBsAg阳性孕妇以及临床普通乙肝患者体内 HBV基因的相应区段序列进行同源性比较分析。 结果:①HBV全长聚合酶链反应的建立:经全长peR &41L优化,PCR反应体 系为:10XBuffer 4.snl,25InM MgCI。3ul,10filM dNTP Inl,引物 PI、PZ 各 30PM,模板 5 PI,无菌水至 45卜 l,石蜡油 3滴封顶,经热启动(KR反应混 合物加热至 85C后,加入酶反应混合物 5 ul,包括 Taq/e。DNA混合酶 2.6u, 10 X Buffer 0.5 ul,无苗水)进人 KR循环;PCR反应参数:94℃ 45秒,60’C 1分钟,72’C 4分钟(每循环自动增加延伸时间5秒),40个循环后,72C延伸 10分钟。用新建立的全长基因扩增方法,对10份新鲜乙型肝炎患者血清标本扩 增后,3份出现了 3.Zkb的扩增片段,且该 3份样本均为 HBsAs、HBeAe、nt i-HBc 全阳性,同时以质粒为模板的扩增全部出现了目的扩增产物的核酸带。以相同样 本用该方法多次重复扩增,结果全长PCR目的产物带清晰,重复性稳定。获得的 HBV重组质粒用PCR法、酶切法和测序法进行鉴定,均证明所获重组质粒为全长一HBV重组质粒。②用全长HBV扩增方法获得8例HBsAg阳性孕妇体内HBV全长 基因克隆,其中发生宫内传播和未发生宫内传播的孕妇各4例,每例选取5个全 长克隆,对其前S亿基因进行测序及序列分析。结果显示,所测克隆的核昔酸序 列均属于HBV C基因型。发生宫内传播的HBSAg阳性孕妇的20个克隆中碱基平 均替代率为3.she、缺失率为0.7be、插入率为二.21咒未发生宫内传播的HBsAs 阳性孕妇的20个克隆中碱基替代率为2.27%,缺失率为0 Zbe,插人率为0.26%, 三种突变模式中以替代最为常见。对两类各20个克隆的碱基平均突变率做/检 验,f值为 11,Pm.001,有较为显著的差异。HBV前 S乃区各克隆间的核昔酸 变异亦显示,发生宫内传括的HBSAg阳性孕妇体内5个克隆间核昔酸变异较大。 对两类HBsAg阳性孕妇每例5个克隆间的平均同源性作t检验,t值为2.92, P<0.05,有统计学意义。③对2份HBsAg阳性新生)L血清HBV DNA前S/S区进 行扩增并测序。所测序列与己获得的其HBSAg阳性母亲5株全长基因的相应区段 序列同源性比较,结果分别为88.6~99.9%,93.2~99.W;与其它HBsAg阳性 二 O@罕呕大o颀士讼大孕妇体内HBV全长基因相应区段序列同源性比较,结果分别为79.9~92.h、80S~90.化:与3例临床普通乙肝患者体内HB V全长基因中5基因的7835p相应区段序列同源性比较,结果分别为84.l~92.6兄85.6~gi.乃。 结论:①HBV全长聚合酶链反应目的产物带清晰,重复性稳定,所获HBV全长克隆经PCR、酶切、测序三种方法鉴定,均证实为HBV全长克隆、表明HBV全长基因扩增技术的建立是成功的,但这种方法更适用于对高拷贝模板的扩增。②发生宫内传播的孕妇较未发生宫内传播的孕妇体内 HBV前S乃区基因异质性高,碱基突变率亦显著增高,说明孕妇体内HBV基因异质性增高可能较易发生宫内传播。③新生儿体内HBV前S店基因与其HBSAg阳性母亲体内全长基因相应区段序列?
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