本文在对流动儿童心理状况研究的相关文献进行综述与评价的基础上，利用2006年11月在北京市某区进行的“流动儿童发展状况跟踪调查”的基期数据，描述了北京市某区儿童心理健康的现状；并利用分层线性模型(Hierarchical Linear Model，HLM)，以代表儿童心理状况的孤独感为因变量，分析流动儿童与本地常住儿童、公立学校的流动儿童在心理状况上的差异，及其主要的影响因素。在此基础上，讨论流动儿童学校的存在对于流动儿童心理健康发展的合理性，以及改进的方向。本文认为，三类儿童在心理孤独感上差异显著；流动儿童的孤独感确实受很多因素的影响，主要包括家庭、学校和社会三大方面的影响因素；孤独感总差异中的10％来自学校不同引起的差异；在这些影响因素中，学校的社会经济地位，作为宏观层面的影响因素，通过儿童的自身、家庭及社会的特征，间接影响到儿童的心理孤独感，并改变这些因素的作用强度。因此关注流动儿童的心理健康，除了儿童自身相关影响因素之外，在学校享受到公平的教育资源，是非常重要的。