SIRT6医学信息分析及其在肾癌中的作用

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目的:SIRT6属于Sirtuin蛋白家族的7个成员之一,是酵母沉默信息调节因子Sir2的同源物,SIRT6的研究已经拓展到多种疾病中,SIRT6对多种生命活动的调控作用逐渐被阐明,与之相伴的是大量关于SIRT6相关文献的快速产生。然而SIRT6的计量学信息特征仍然未知。在肿瘤中,SIRT6是一把双刃剑,其既能作为抑癌基因又能作为致癌基因而发挥作用。然而尚未有研究揭示SIRT6对肾癌细胞的生物学功能及其与肾癌患者预后间的联系。因此,我们将以此为契机,在SIRT6的科学计量分析部分(第一部分)我们将运用一系列科学计量工具对SIRT6进行计量信息分析,探索SIRT6的计量学特征。在SIRT6对肾癌的作用研究部分(第二部分),我们将鉴定SIRT6对肾癌细胞增殖,迁移和侵袭以及化疗敏感性方面所扮演的角色,为肾癌靶向治疗奠定理论基础。方法:在SIRT6的科学计量分析部分(第一部分),本研究检索了web of science数据库中核心合集中时间范围从2000.01.01-2018.04.28的关于SIRT6的Article类型文章作为研究样本。文献一共有441篇,并下载储存为TXT格式。使用Bicomb软件提取高频的高频词,并依次构建词篇矩阵和共词矩阵,利用Gcluto进行双聚类分析。利用EXCEL构建战略坐标。利用Citespace计量学分析软件进行共被引网络分析,利用Vosviewer进行期刊及密度分析。在SIRT6对肾癌的作用研究部分(第二部分),本研究通过在线生物息分析工具ULCAN分析SIRT6表达水平在肾癌组织与正常组织的表达差异,探索SIRT6表达高低与肾癌分级和预后的关系。在肾癌786-O,769-P细胞系中,利用siRNA敲除SIRT6,利用克隆形成实验,CCK8实验,细胞划痕实验,Transwell实验检测SIRT6对肾癌细胞增殖,迁移和侵袭以及化疗敏感性的影响。利用Western blot实验检测验证siRNA敲除效率及其对下游蛋白的影响。结果:在SIRT6的科学计量分析部分(第一部分)本研究通过共词研究方法分析得出SIRT6的8个研究热点以及SIRT6热点术语随时间的变化情况。利用共词矩阵及词篇矩阵构建热点战略坐标判断各热点的研究前景和彼此联系。本研究通过构建SIRT6的共被引网络及聚类信息得出SIRT6的8个知识基础,鉴定出了在SIRT6共被引网络中的重要节点,同时对SIRT6的引用学科及期刊进行了可视化分析。在SIRT6对肾癌的作用研究部分(第二部分),生物信息学分析表明SIRT6在肾癌组织中高表达,且其表达高低与肿瘤分级和预后相关。通过CCK8实验及克隆形成实验,研究发现SIRT6具有促进肾癌细胞增殖的能力,通过细胞迁移实验和Transwell实验,研究发现SIRT6能促进肾癌细胞的迁移能力和侵袭能力,敲除SIRT6能增加肾癌细胞对顺铂化疗的敏感性,并下调NF-kB,cyclinD1蛋白水平表达,上调Beclin1蛋白水平表达。结论:在SIRT6的科学计量分析部分(第一部分),本研究得出以下结论(1)Sir tuin家族对SIRT6的研究发展起到重要作用,SIRT6对染色质,寿命,DNA损伤,代谢的调控研究是SIRT6近十年该领域最重要的研究基础。(2)除肿瘤,衰老外,SIRT6在神经系统疾病中的作用也具备研究前景,SIRT6的研究呈现出向肿瘤领域集中的趋势。(3)MOTOSLAVSKY在2006年的研究对SIRT6领域的发展具有里程碑意义,KAWAHARA TLA(2009)和KIM HS(2010)的研究对SIRT6的知识传承具有枢纽作用。在SIRT6对肾癌的作用研究部分(第二部分),本研究得出以下结论:(1)SIRT6在肾癌组织中高表达,其表达水平与肿瘤分级、预后相关,高表达的患者预后差。(2)SIRT6促进肾癌细胞的增殖,迁移和侵袭能力,敲除SIRT6能增加肾癌细胞对顺铂的敏感性。(3)在肾癌769-P细胞系中,SIRT6能促进NF-kB,cyclin D1蛋白水平的表达,并抑制Beclin-1蛋白水平的表达。
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