水稻粒宽基因GS5的调控与分子机理研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:dongwujunye
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水稻是最重要的粮食作物之一,如何提高水稻产量一直是科学研究与育种研究长期关注的重点。水稻产量由单位面积穗数、每穗实粒数和千粒重三个因素构成,千粒重由颖壳的体积和胚乳发育状况两个因素决定,对颖壳形状与体积的描述一般称为粒形,包括粒长、粒宽和粒厚,因此,粒形是重要的产量性状之一。前人通过图位克隆法分离到GS5,它是第五染色体上的一个正调控粒宽、粒重和灌浆速率的微效基因,窄粒等位基因GS5-H94与宽粒等位基因GS5-ZS97之间的差异主要是启动子区存在的18个多态性位点造成两者表达水平的高低不同。提高GS5的表达量可以增加粒宽,因为GS5影响了一系列细胞周期调控基因的表达,GS5表达量的提高可以促进颖壳细胞分裂,增加颖壳细胞数目。本研究主要内容包括:  ⑴GS5在绿色组织中的表达水平远高于非绿色组织,在非绿色组织中表达量最高的是发育中的幼穗。在幼穗发育过程中宽粒等位基因GS5-ZS97的表达量高于窄粒等位基因GS5-H94,而在绿色组织中GS5-H94的表达量反而更高,暗示GS5的表达受到至少两种不同因素的调控。  ⑵GS5启动子的顺式作用元件大部分是光响应元件,两个等位基因的多态性位点主要造成光响应元件的数量不同,GS5-H94含有更多的光响应元件。研究证实GS5的表达受光照诱导,并在一天中表现出节律性变化。GS5-H94受光照诱导后表达量的改变更为剧烈,因此,可以解释GS5在绿色组织中高表达,且GS5-H94拘表达量高于GS5-ZS97。  ⑶利用一系列截短与定点诱变的启动子-GUS(β-Glucuronidase)片段分析造成幼穗中表达量差异的关键位点,发现启动子-1139 bp至-931 bp(记为B区)对GS5的差异表达具有最关键的影响。比较GS5-H94、GS5-ZS97与来自宽粒品种中花11的第三种单倍型GS5-ZH11的启动子-1139 bp至-604 bp区段(B、C区),鉴定出GS5-H94特有的三个SNPs(SNP_-1109,SNP_-1032和SNP-825),将GS5-ZS97的SNP_-1109和SNP_-1032诱变为GS5-H94基因型可将其启动子强度降低到GS5-H94水平上。  ⑷启动子B区的SNP-1109和SNP-1032位于一个GA(Gibberellin)响应元件侧翼,C区的SNP-825造成两个等位基因产生一个光响应元件的差异。将GA响应元件诱变缺失后,启动子强度上升,表明GA响应元件的作用是抑制表达;将光响应元件诱变后,启动子强度下降,表明光响应元件的作用是促进表达;在幼穗中,GA响应元件对启动子强度的影响更大。激素处理结果表明GS5的表达不受GA影响,但ABA(Abscisic Acid)对GS5-H94的表达有明显的抑制作用,对GS5-ZS97的影响则不明显,从而造成GS5-H94的表达量低于GS5-ZS97。  ⑸GS5是一种丝氨酸羧肽酶类蛋白,GS5-H94和GS5-ZS97的蛋白质功能没有差异,表达量的提高都可以使粒宽增加。GS5是分泌性蛋白质,定位于细胞表面,与细胞膜之间存在密切联系。过量表达时有相当一部分GS5蛋白滞留在内质网中。  ⑹酵母双杂交筛选到GS5可与细胞膜蛋白OsBAK1-7(拟南芥BAK1(BRI1-Associatied Kinase1)的同源基因)的胞外LRR(Leucine-Rich Repeat)结构域互作。如同拟南芥的报道,OsBAK1-7的LRR结构域也可与OsMSBP1(拟南芥MSBP1(Membrane Steroid-Binding Protein1)的同源基因)互作,这种互作会促进OsBAK1-7的内吞。本研究表明当细胞表面存在大量的GS5蛋白时,GS5与OsBAK1-7的互作会竞争性抑制后者与OsMSBP1的互作,从而阻止OsBAK1-7的内吞。这种竞争性互作可以在一定程度上解释为什么GS5的表达水平与表型正相关。  ⑺GS5的表达受到BR(Brassinosteroids)的抑制;拟南芥BR信号转导途径中的一个丝氨酸羧肽酶BRS1在水稻中的超表达也可使粒宽增加,且粒宽也与其表达水平正相关;加上GS5与OsBAK1-7的互作关系,暗示GS5很可能通过BR信号转导途径调控颖壳细胞分裂和粒宽。OsBAK1-7超表达后植株半矮,茎秆变细,缺失突变体株高增加,茎秆变粗,可能对水稻生长具有一定的抑制作用,但粒形没有变化;OsMSBP1在各个组织时期都有很高的表达,其缺失突变体成苗率极低,绝大部分在萌发后死亡,植株矮化、分蘖减少、粒形变小,表明它对水稻生长有必不可缺的作用。这两个基因在BR信号转导中的作用还需进一步研究,目前的初步结果认为它们对水稻生长的作用是相反的,GS5通过对它们互作平衡的调节实现对表型的控制。  ⑻对527份核心种质材料和17份野生稻材料进行GS5的比较测序,从ATG上游2 kb到3-UTR共6.4 kb的区间内鉴定出130个SNPs和27个InDels,其中70%以上的多态性位点分布在2 kb的启动子区。根据这些多态性位点可将GS5分成49个单倍型(Haplotype),归为12个单倍群(Haplogroup)。一共鉴定出10种完整形式的GS5蛋白类型,它们之间只有少数氨基酸的差异,没有发现提前终止的类型,其中GS5-P2(即GS5-H94)是最古老的蛋白质类型,GS5-P1(即GS5-ZS97)形成较晚。  ⑼四大单倍群中,GS5-1型(即GS5-ZS97型)和GS5-2型(即GS5-H94型)主要分布在籼稻中,GS5-3型(即GS5-ZH11型)主要分布在粳稻中,GS5-4型主要分布在aus稻中。由于群体结构的存在,只能比较籼稻中GS5-1型和GS5-2型材料的粒形差异,为了剔除同一染色体上粒宽主效基因qSW5/GW5的效应影响,对其基因型进行鉴定。结果发现相同qSWS/GW5基因型的材料中GS5-1型和GS5-2型材料的粒宽没有显著差异,表明GS5的微弱效应在自然群体中被掩盖了。  ⑽在籼稻IndI亚群中检测到GS5的Tajimas D值显著小于0,π值非常低,且该亚群中绝大部分是GS5-1型材料,暗示形成较晚的GS5-1可能受到人工选择,但其微弱的效应似乎不太可能被人类发现和选择。分析发现Rc或Wx等驯化基因的突变并不影响GS5-1和GS5-2的基因型频率,但当qSW5/GW5位点发生突变,产生显著的大粒表型后,GS5-1的基因型频率便大大上升。由于GS5与qSW5/GW5位点之间相距仅2Mb并存在一个连锁不平衡区域(LD block),表明GS5位点受到qSW5/GW5位点受选择的搭载效应影响,而且籼稻中qsw5/gw5的突变发生在GS5-1的背景下。
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