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糖酸含量是影响番茄果实品质特性的关键指标之一。在长期的育种研究中,一般用可溶性固形物来间接反映番茄果实中的总糖分,利用可滴定酸来反映有机酸的含量。番茄果实糖酸性状是一个典型的由多基因控制的数量性状,国内外针对番茄果实具体糖酸组分的QTL研究十分有限。本研究以174份具有广泛代表性的番茄种质为研究材料,对2014年的番茄红熟期果实中的主要糖酸组分利用气质联用仪进行了测定;利用182对覆盖番茄全基因组的SSR标记对本试验群体进行了分子标记,并对该群体的遗传多样性、群体结构、连锁不平衡进行了分析;最后利用182对SSR标记对番茄主要糖酸物质进行了全基因组关联分析。主要结果如下:1.利用气质联用仪(GC-MS)对174份具有广泛表型变异的番茄材料红熟期果实中的主要糖酸组分进行了测定和分析。共检测到17种主要糖酸组分物质,包括8类糖类物质和9种有机酸类物质。其中主要的糖类物质包括葡萄糖、果糖、蔗糖、半乳糖等,主要的有机酸类包括苹果酸、柠檬酸、琥珀酸、丁酸、脯氨酸等。主要糖酸组分之间一般存在着较高的相关性,其中葡萄糖和半乳糖之间的相关系数达到0.958;果糖、葡萄糖和苹果酸、谷氨酸、琥珀酸之间均为极显著的负相关关系。番茄果实主要糖酸组分和其他果实品质指标之间也存在着较为复杂的相关关系。2.利用182对SSR标记对174份番茄材料的群体结构和连锁不平衡进行了分析。结果表明,可以将这174份番茄材料分为樱桃番茄和大果番茄两个亚群。利用182对SSR分子标记对群体的LD值进行评估,该群体的LD平均衰减距离约为8cM。LD结果表明利用较少的SSR标记进行关联分析就可以得到显著关联的标记位点。3.利用混合线性模型,通过对番茄果实中主要的17种糖酸组分进行全基因组关联分析,共检测到139个显著关联位点,其中在2013年和2014年分别检测到97和83个显著关联位点,其中有58个显著关联位点达到极显著水平(P<0.001)。除了苏糖醇外,在其他的16个糖酸物质上至少检测到一个显著关联位点。本研究定位到了一些前人报道的与番茄果实糖酸相关的QTL或基因,如fru9.1/PV、suc9.1/PV、ca2.1/HS、ca3.1/PV、ca4.1/PV、ca8.1/PV和Solyc06g072930.2等。本研究为番茄果实主要糖酸组分合成代谢调控关键基因的定位和挖掘奠定了基础,对番茄的糖酸品质育种具有重要意义。