水稻表观基因组图谱和数据库的构建

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong489
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因组表观修饰在不改变DNA序列特征的情况下对基因的转录调控起着非常重要的作用。水稻既是重要的经济作物,也是在基因组学领域内除了拟南芥和玉米等广泛研究的模式植物外,研究最多的禾本科植物,但在水稻基因组中尚未绘制出全面的多组织多品系的参考表观基因组图谱。本研究总共通过4个不同组织(幼叶、成熟叶、幼穗和根)和20个不同品系的染色质开放区域信号、DNA甲基化、转录组、组蛋白修饰的表观基因组数据整合分析了全基因组综合表观基因组图谱。这些表观数据注释了大约81.8%的水稻基因组区域,这些注释区域都表现出了不同
其他文献
杂草是影响水稻产量和品质的主要因素之一,已经对许多农业系统构成了威胁。草甘膦是一种效率非常高的有机磷除草剂,已在世界范围内被广泛使用。抗草甘膦转基因作物与草甘膦配合使用技术是现代农业中一种重要的杂草管理方式。当前单独应用且能够赋予转基因水稻对草甘膦足够和稳定的抗性的基因只有EPSPS基因。这种方法的缺点是草甘膦仍然在水稻植株中积累和转运。然而降解草甘膦的基因单独应用不能满足商业化应用的需求。亟需挖
学位
实验目的:本研究从细胞水平和动物水平,基于合成的雷公藤红素探针(celastrol-prob,cel-p),联合串联质谱标签(Tandem Mass Tag,TMT)标记、细胞热转变分析(Cellular Thermal Shift Assay,CETSA)、免疫荧光(immunofluorescence,IF)、蛋白免疫印迹(western blotting,WB)等实验技术研究了活性天然产物雷
学位
水稻(Oryza sativa L.)作为重要粮食作物之一,养活了世界上超过半数的人口。白米是稻米最常见的消费形式,但是在亚洲、欧洲和美洲的某些国家和地区人们也经常会吃有色米,例如黑米和红米等。黑米是一种稀有的水稻种质,富含具有抗氧化特性的花青素。科学研究已经证实黑米及其提取物可以帮助人类预防或缓解肥胖、高血糖、非酒精性脂肪肝炎、骨质疏松和癌症等慢性疾病。由于黑米的抗氧化和抗炎特性,黑米也可以保护
学位
油菜花芽分化的启动时间可决定花芽形成数量的多少,而有效花芽数量在很大程度上决定了油菜角果数与籽粒产量。本文主要以早熟品种“1358”、中熟品种“中双11号”和晚熟品种“浙双8号”等三个不同熟期品种为试验材料,进行了播期、氮肥、密度等系列比较试验,系统地研究了不同气候条件下油菜花芽分化的启动时间及其与环境条件的关系,探讨了花芽数量的动态变化规律及其与角果数和产量形成的关系;同时结合澳大利亚的油菜品种
学位
粒重是油菜产量的重要构成因素之一,受复杂的基因网络调控。粒重相关基因的克隆及其调控机制解析对了解油菜种子发育及产量形成的遗传学基础及产量改良具有重要意义。本课题组前期在一个DH系群体中将粒重QTL qSW.C9与每角果粒数QTL qSS.C9共定位,发现BnaC9.SMG7b是控制每角果粒数的基因,同时发现其附近的BnaC9.RINGb可能是调控粒重的基因。进一步研究发现BnaC9.SMG7b对粒
学位
甘蓝型油菜主要用于榨油,其饼粕用作动物饲料。油菜的产量和品质相关性状一直是育种工作者们关注的焦点。角果相关性状与油菜的产量有着紧密的联系,挖掘角果相关性状的QTL、克隆这些QTL的目标基因并解析它们的功能可以为品种改良提供有益的遗传信息。同时,提高油菜种子的含油量,降低其硫苷含量,则有助于提升油菜籽的经济价值。目前,油菜品质相关性状的研究主要停留在QTL定位阶段,鉴定新的品质相关性状QTL位点、克
学位
油菜是最重要的油料作物之一,是生产食用油的主要来源。不同的环境胁迫尤其是盐胁迫显著抑制植株的生长和发育,最终降低产量。种子引发是最重要的缓解盐胁迫的方法之一,尤其是使用纳米材料进行引发具有较高的潜在利用价值。本研究的主要目的是明确纳米材料引发在缓解油菜盐碱胁迫上进行利用的理论依据,同时也增强对盐胁迫对油菜生长发育影响的理解。主要试验内容和结果如下:(1)盐胁迫抑制幼苗的生长,同时改变幼苗早期生长发
学位
油菜是我国食用植物油最主要的来源之一。近年来随着耕地面积的减少与人口老龄化导致的劳动力下降等因素使我国油菜种植面积呈逐年下降的趋势。因此,如何增加油菜产量已成为育种家和科研工作者首要解决的问题。每角粒数是油菜产量的三大构成因子之一,也是经过胚珠起始和胚珠/种子发育等复杂生理过程产生的最终性状。然而,以往的研究大多集中在每角粒数本身,而忽略了其形成过程中其它相关性状的研究。为了解析每角粒数及其相关性
学位
冬油菜(Brassica napus L.)是我国重要的油料作物,钾肥施用不足显著降低油菜籽的产量。作物产量主要来自于光合产物的积累,而作物光合能力由光合面积与光合速率共同决定。作为渗透平衡离子,钾在调控气孔功能和CO_2传输方面的研究已比较明确,但对于钾营养在协调叶面积和光合速率中的作用以及影响光合羧化固定的生化调控机制研究不足。针对以上问题,本研究采用田间试验和水培试验,从细胞形态特征和代谢生
学位
由于世界人口不断增加和环境的持续恶化,预计到2050年,作物的产量必须翻倍才能满足全球对粮食的需求。源-库互作的过程是作物产量形成的实质,利用常规育种或基因工程改善植物源-库关系在作物高产遗传改良中具有重大的潜力。改善作物源产量、物质运输能力(流)和库容量的主要研究策略包括:增源,例如增加作物的光合速率或同化物的总量;促进同化物的源-库流动和扩大库容等。但是,源、库、流三者之间相互促进、影响和制约
学位