MiR-21对人脑胶质瘤细胞(U373MG)增殖的影响及其靶位点的确定

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目的:microRNA(miRNA)是一类调控性非编码短序列RNA片段,是广泛存在的对基因表达进行微调的分子,参与生命过程中的一系列重要进程,有研究表明miRNA可能与肿瘤有潜在的关系,在不同组织来源的肿瘤细胞中,miRNA的表达水平及其调节作用是不同的。本研究结合生物信息学、基因芯片及报告基因技术预测和确定miR-21在人类肿瘤细胞中的靶基因,并对miR-21通过调控靶基因而在肿瘤细胞中发挥的生物学功能进行进一步研究,为理解miR-21在肿瘤形成过程中的作用提供依据。方法:利用脂质体法将miR-21、24、190、214四种miRNA的反义寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)转染至U373MG细胞,以gapas control为对照,用MTT法检测细胞活性的变化,并用基因芯片技术分析比较转染miR-21ASO和gapas control组基因表达谱的变化。结合生物信息学技术与基因芯片结果预测和筛选miR-21的靶基因,并构建pCDNA3/EGFP-LRRFIP1 3′UTR载体,并通过检测GFP报告基因的方法进行验证。结果:1.抑制miR-21功能后,MTT法测得结果显示U373MG细胞活性明显下降(P<0.05),而抑制miR-24、190、214的功能后,U373MG细胞活性变化不明显。2.基因芯片结果显示抑制miR-21功能后,与对照组相比,mRNA表达谱有明显变化,表达上调基因有179个,表达下调基因有153个,这些改变的基因按功能可分为:细胞因子相关基因、信号转导相关基因、肿瘤相关基因、凋亡相关和肝酶代谢相关基因。3.从这些基因中,我们根据功能选取部分基因,采用半定量RT-PCR进行验证其中LRRFIP1、SHB、PTK2、FLII、MYLK、HDAC1、AKT1、PTPRF、CDB1、ITGB4、CLU、PPP2R1A,是上调的,而PDCD5、STK6、GADD45B、YY1则是下调的,其结果与基因芯片结果相符。4.用利用生物信息学技术来预测miR-21可能的靶位点,并通过检测GFP报告基因的方法证实LRRFIP1为靶基因。结论:miR-21在U373MG细胞中作为一种抗凋亡因子,通过转染其反义链寡核苷酸特异性抑制其作用后,U373MG细胞活性明显下降,基因芯片及半定量RT-PCR结果显示一些与细胞周期调节和凋亡相关的基因上调/下调,可能与调节肿瘤细胞在增殖与凋亡之间达到一个新的平衡有关。预测并确定了LRRFIP1是miR-21在人类肿瘤细胞内的直接靶基因,miR-21可通过与LRRFIP1mRNA的直接作用,对细胞的凋亡进行调节。
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