我国的教育体制产生于计划经济的大背景下，在党的十四大之前，为了匹配当时高度集权的政治体制和经济体制，高校习惯被定位为政府的隶属机构，政府与高校的关系体现为自上而下的领导关系，管理权集中于上级政府，在两者的关系中突出表现为政府本位。伴随着政治体制改革的不断深入和社会主义市场经济体制逐步建立，高等教育体制所面临的是根本性的变革。《中国教育改革和发展纲要》、《高等教育法》、《国家中长期教育改革和发展规划纲要》（2010-2020）、《十二五规划纲要》等一大批政策法规的出台，进一步提出，加快建设现代高校制度，健全多渠道筹集教育经费体制，落实和扩大高校办学自主权，明确中央和地方责任，加强省级政府教育统筹。“十二五”时期是深化改革开放、加快转变经济发展方式的关键时期，优先发展教育、提高教育现代化水平，对实现全面建设小康社会奋斗目标、建设富强民主文明和谐的社会主义现代化国家具有决定性意义。虽然教育体制改革一直受到党中央的高度关注，但是以全能主义和权力本位主义为特征的各级政府对高校的各种公共事务进行直接的，微观的干预，形成了一种政校不分，政事不分，高度集权的高校管理体制，阻碍了改革的进一步推进。伴随着计划经济产生的巨大惯性和历史原因，在我国高等教育管理中，政府和高校的关系一直被认为是“控制与被控制”。从行政法的角度看，政府是掌握了国家教育权的行政主体，而高校是处于行政行为下的相对主体，其对于政府的行政指令等只能采取自下而上的服从行为，高校逐渐成为政府的附属部门，政府在高校的办学管理、资源财政投入、成果分配等方面占据主导地位。文章采用文献分析法、类比分析法、规范分析法、实证分析法等研究方法，深入研究政府教育职能转变的问题。首先通过对文献资料的筛选和研究，可以了解政府教育职能转变的研究现状以及国外相关的研究，并在学者们研究理论的基础之上，进一步以政校分开为切入点进行研究。其次通过对国外政府教育职能转变情况进行比较分析，以此总结他们的经验和教训，从而探究对我国现阶段政府教育职能转变的借鉴意义。再次，本文对政府教育职能转变理论进行了分析，研究的过程中还会涉及新公共管理理论、新公共行政理论、多中心治理理论等相关的内容。最后，实践是检验真理的唯一标准，学者们对于政府教育职能转变的理论只有运用到实践中，才能知道各种模式是否有效或者在不同的政治经济环境下应该选取哪些不同的模式。对教育体制历史的研究、国内外现实状况的分析以及经验的借鉴，都离不开实证分析。相对于“政府提供”和“自主办学”的单一思维和闭合有界的治理形态，文章在政府教育管理职能转变机制方面，力求突破政府和高校的二元的、静态的管制形态，而着眼于政校间动态关系的探讨。总之，政府作为高校教育管理体制改革的关键，在改革中必须摆正自己的位置，真正承担起改革主体的重任。必须加快政府职能转变，加强宏观管理职能，完善监督职能和服务职能，从而推进高等教育的改革。高等教育管理体制改革涉及到一国的政治、经济、文化、科技体制以及种种社会。政府与高等院校的关系问题也不是高等教育管理体制改革中的唯一问题，在高等教育管理体制改革中政府还需要进一步明确理顺高校与高校之间的关系，引入多元主体，深化市场化进程。因此，政府在高等教育管理职能定位，需要在深化管理体制改革的进程中，以治理理论为依托，根据实践的发展不断探索完善。