我国的保税区自1990年开始设立,至今共设立了15个,随着其不断的发展进步,为了改善区港分离的状况,政府计划推行保税区与临近的港区的联动,在2004年,正式设立8个保税物流园区进行联动试点,但经过三年的发展,保税物流园区的特色功能优势开发不足,并与保税区在重叠的部分功能上形成竞争。本文的基本推理结构是,首先通过对我国保税物流园区与保税区的发展现状分析,以及与国外自由贸易区发展的比较,明确差距所在,确定其走向自由贸易区的发展方向。其次,利用国外的成功发展经验,探讨保税物流园区与保税区的管理架构及发展模式。在向自由贸易区发展的过程中,如何更好地利用现有资源,获取更大经济效益,成为本文分析的焦点。然后,通过运用博弈论原理,分析在保税物流园区和保税区的竞争研究中采用博弈论的可能性,通过建立价格博弈模型和资源博弈模型,得出保税物流园区与临近保税区合作发展可使双方长期利益更大的结论。论文的最后,运用厦门保税物流园区与保税区的案例,分析其合作的可能性和必要性。