黑叶猴(Trachypithecus francoisi)为灵长目(primates)猴科(ceropithecidae)疣猴亚科动物,主要分布在中国和越南,为世界濒危和国家一级保护动物。广西作为黑叶猴在中国的主要分布区之一,黑叶猴的数量在近30年急剧下降,栖息地破碎化十分严重,保护形势不容乐观。深入了解黑叶猴各地理种群的分子变异及遗传水平现状,可以为黑叶猴保护提供重要的依据。本文以黑叶猴的粪便为实验材料,以线粒体DNA分子标记为研究对象,对采自广西和贵州的145个粪便样品(其中142个样品来自广西的龙州,大新,隆安,扶绥4个县)的线粒体DNA控制区的部分序列的一级结构进行测定,依据测序结果对广西黑叶猴的遗传结构进行初步分析,并对采样和实验工作中遇到的一些问题进行了初步探讨。主要研究结果如下:(1)本次实验共使用了145个样品,最后有110个样品的测序结果可以用于分析研究,黑叶猴的粪便样品的扩增成功率为75.86%。(2)本次分析的广西黑叶猴样品的mtDNA D-loop的长度为395bp,并且有16种单倍型,43个变异位点。(3)在广西4个黑叶猴地理种群中,龙州(GX-LZ)种群的单倍型和多态位点最多,单倍型间核苷酸差异平均数最大。(4)在大空间尺度上,来自贵州和广西的黑叶猴单倍型严格聚类,但在小空间尺度上,来自各县的单倍型在系统树中呈镶嵌分布。(5)通过对全部单倍型进行网络关系分析,我们发现各单倍型间的变异位点数为:1-32个。我们建议:龙州县黑叶猴种群携带的遗传信息较为丰富,为了能更好的保护黑叶猴的基因多态性,应将龙州县的黑叶猴种群列为最优先保护的单元;讨论迁地保护的可行性,加强种群间的基因交流。