棉花是关系国计民生的仅次于粮食的大宗农产品,是新疆农业中的主要经济作物,棉花产业的发展不仅关系到新疆农民的生计和纺织工人的就业,也关系到新疆的外汇收入等等,所以,在新疆整个经济和社会发展中占有非常重要的地位。但是,2008年以来,受国际国内经济大环境影响,国内棉花市场出现了新的状况：一方面,纺织品出口增速放缓,棉花价格疲软；另一方面,农资价格飞涨,植棉成本骤增,棉农收入不乐观。据统计,2007年以来,新疆棉花播种面积连续减少,从根本上威胁着新疆棉花的供给。棉花生产成本的大小直接影响棉花的种植收益、农民的收入和棉花产业发展的方向。那么,在农户经营这个微观层面上,种植棉花的成本和经济效益到底如何?国家和新疆的棉花补偿机制对棉农在生产和流通环节的影响如何?在各种生产要素(化肥、种子、地膜、人工、农药、机耕、灌溉等)的投入中,哪些要素处在较为显著的状态?了解棉花成本的构成、各构成要素在总成本中的比重和正确核算棉花的成本,研究棉花的市场价格如何形成以及成本在价格中究竟起到什么样的作用是提高棉农收入和新疆棉花在国际市场上的竞争力的关键,对促进新疆棉花产业健康发展具有重要的现实意义。本文运用会计学方法、趋势分析法和计量模型等方法,以新疆棉花为研究对象,首先阐述了棉花成本项目的构成及形成机理、棉花经济效益和棉花补偿机制的基本理论,分析了新疆棉花成本变动趋势,并对新疆南北疆棉花成本进行了区域性比较分析。然后对新疆南北疆棉花成本差异、新疆棉花成本和价格关系、新疆棉花经济效益影响因素等进行了实证分析。最后,对新疆棉花成本与补偿机制进行了分析,提出了完善新疆棉花补偿机制和棉花产业的思路与对策。研究内容具体为：第1章：绪论。主要是对本文的研究背景、研究目的和意义、国内外研究动态、研究内容与方法等进行了综述。第2章：棉花成本、经济效益及补偿机制的理论分析与研究。主要介绍和分析了棉花成本项目构成及形成机理、棉花经济效益和棉花补偿机制的基本理论。第3章：新疆棉花成本及其构成变动分析。该章选取1995年至2009年新疆棉花每亩总成本和单位产品总成本这两个指标,对新疆棉花总成本变动的趋势、新疆棉花生产成本变动趋势、新疆棉花生产成本结构及其变动情况、新疆棉花成本构成因素等进行了分析。第4章：新疆南北疆棉花成本区域性比较分析。首先阐述了新疆棉区的分布情况,然后采用实际随机调查的182户农户2009年的棉花数据,对南北疆棉花成本收益情况进行了描述性论述,包括调查地区基本情况描述、棉花生产现状的描述性分析和比较等。第5章：新疆南北疆棉花成本差异的实证分析。首先阐述了南北疆棉花的种植概况,然后选取实际随机调查的182户南北疆农户棉花生产成本2009年的数据,构建了对数线性模型,对南北疆棉花价格和收益进行了比较,分析了南北疆棉花成本和经济效益差异的原因。第6章：新疆棉花成本和价格关系的实证分析。本章选取1990至2009年新疆棉花主要产品产量、同一时期的农业生产资料价格指数、每50公斤棉花生产成本、棉花每50公斤平均出售价格、棉花生产中的额外费用等数据,建立了棉花成本、收益的理论模型,并做了相关的检验,对棉花成本和价格的关系进行了估计和分析。第7章：新疆棉花成本及经济效益现状分析。首先介绍了棉花经济效益影响因素的模型,然后选取实际随机调查的182户南北疆农户棉花生产成本2009年的数据,建立了生产函数,进行了回归分析,并用分解经济效益差异的Blinder-Oaxaca方法,对影响棉花经济效益的因素进行了分解分析。第8章：新疆棉花成本与补偿机制分析。从内生性补偿和外生性补偿两个方面分析了棉花的成本和补偿机制。第9章：完善新疆棉花补偿机制和棉花产业的思路与对策。首先提出了完善新疆棉花补偿机制的思路与政策,然后对新疆棉花产业的发展提出了政策建议。第10章：结束语。主要谈了研究小结、研究结论以及研究创新及局限性等问题。