1994年,我国实行分税制财政体制改革,并建立了与分税制财政体制改革相适应的国家税务局、地方税务局两套税务机构,经过13年的实际运行,取得了较为明显的效果。但是也应当看到,当年实行分税制并分设税务机构,是特殊时期的一种过渡性产物,无论从制度的设计、安排还是运作来看都并不规范,随着国内政治、经济形势和税收征管手段的快速发展,税务机构分设的弊端日益凸现,暴露出了不少深层次的问题。实践证明,税务机构分设已不适应新形势下税收征管工作的需要,合并是当前税务机构设置的理性选择。党的十七大提出要进一步深化财税体制改革,完善公共财政体系,建立中央和地方财力与事权相匹配的体制,将对今后税务机构的设置将产生重大影响。因此,在关注税制改革的同时,也要加强对作为我国税收征管主体的税务机构本身改革问题的思考。文章根据行政学、管理学和公共经济学的理论,分析了影响税务机构设置的主要因素,探讨了税务机构设置的原则,回顾了我国建国以来税务机构的设置情况和发展方向,剖析了机构分设带来的税收成本高、征管效率低、信息共享难、执法不统一等方面的问题,从适应我国政治经济体制、优化纳税服务、减少税收成本、促进和谐社会建设等角度,讨论了税务机构合并的必要性,认为在新形势下,随着税收法制化水平的提高、监督手段的完善、信息化进程的加快,税务机构合并的时机和条件已经成熟,提出应结合我国政治经济体制和税收管理的实际情况,实行分税制而不分税务机构,进一步改革和完善分税制财政体制,按照“精简、效能、统一”的原则合并税务机构,整合税收工作流程,优化办税服务手段,进一步加快税收信息化进程,建立和完善地方税体系,加大转移支付力度,合理切分税收收入蛋糕,明确中央和地方的责、权、利关系,强化税务队伍建设,从而建立适应我国社会经济现状的成本低廉、运行高效、管理规范、服务优质的税务机构。