分子对接在药物设计中的应用

来源 :中国科学院上海药物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wenpeson
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分子对接是一种行之有效的计算机辅助药物设计方法,文献中已经有许多成功的范例报道.因此,将这一方法应用于药物研究可以大大加快发现药物先导化合物的速度.研究人员利用分子对接方法对酪氨酸激酶抑制剂以及乙酰胆碱酯酶抑制的设计是行尝试.发现了一些酪氨酸激酶具有抑制活性的化合物.乙酰碱酯酶是一个重要的抗老年性痴呆症药物作用靶标,研究人员根据E2020中对相互作用具有较大影响的基因及其几何距离关系设计了三维药效基团模型.利用分子对接的方法研究了双拼石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶可能的结合方式以及可能的相互作用,并预测其中几种化合物可能具有较好的生物活性.艾滋病是一种严重威胁人类健康与生命的疾病,药物化学家在进行合成药研究的同时,对天然产物也越来越感兴趣.白桦子酸、齐墩果酸是两类具有抑制HIV-1感染活性的化合物.研究人员利用比较分子力场方法对白桦子酸、齐墩果酸和12,13-二氢齐墩果酸三类化合物的31个衍生物进行了定量构效关系研究.利用这些化合物的结构差异解释了它们的活性差异,并对一些尚未合成的化合物进行了活性预测.将分子对接程序DOCK 4.0在福州超级计算机上并行化.研究人员对福州超级计算机的计算结果进行了分析.
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